RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 SH3GL1Q99961 368 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 MXD3Q9BW11 206 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 PLK2Q9NYY3 685 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 THEGQ9P2T0 379 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 TAGLN3Q9UI15 199 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 ASTN1O14525 1302 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 ROBO3Q96MS0 1386 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 ARHGAP42A6NI28 874 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 PHKA2P46019 1235 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 ARHGAP4P98171 946 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 VPS72Q15906 364 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 FAAH2Q6GMR7 532 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 POTEHQ6S545 545 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 MARVELD2Q8N4S9 558 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 CENPOQ9BU64 300 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 NUP85Q9BW27 656 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 PLVAPQ9BX97 442 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 OSBPL6Q9BZF3 934 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 RRN3Q9NYV6 651 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 USP21Q9UK80 565 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 APPL1Q9UKG1 709 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 CACNA1SQ13698 1873 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 KCPQ6ZWJ8 1503 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 CAPN8A6NHC0 703 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 MEI4A8MW99 385 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 OCM2P0CE71 109 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 FDFT1P37268 417 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 FAM209AQ5JX71 171 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 DCDC5Q6ZRR9 648 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 SMYD3Q9H7B4 428 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 MYH11P35749 1972 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 A0A088AWK7 358 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 FMO5P49326 533 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 IGBP1P78318 339 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 NSMFQ6X4W1 530 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC89Q8N998 374 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 APEX2Q9UBZ4 518 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa18.42■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 LRP5O75197 1615 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 CD48P09326 243 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 MECOMQ03112 1051 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 SNAPC2Q13487 334 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 HIC1Q14526 733 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 BIRC8Q96P09 236 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 PRELID1Q9Y255 219 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 PIK3CDO00329 1044 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 MTA2O94776 668 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 EEF2P13639 858 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 CBWD6Q4V339 395 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF394Q53GI3 561 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 CBWD3Q5JTY5 395 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 CBWD5Q5RIA9 395 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 CLEC4GQ6UXB4 293 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 HIPK4Q8NE63 616 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 DDHD1Q8NEL9 900 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 HAS1Q92839 578 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 C17orf75Q9HAS0 396 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 SLC38A7Q9NVC3 462 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 TMOD2Q9NZR1 351 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 MGEA5O60502 916 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 BGNP21810 368 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 PHBP35232 272 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 SERPINB6P35237 376 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 ARL13BQ3SXY8 428 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 ALLCQ8N6M5 410 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 DTNAQ9Y4J8 743 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 IQCA1LA6NCM1 817 aa18.4■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 E5RJQ4 531 aa18.4■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 TM9SF1O15321 606 aa18.4■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 TNNI2P48788 182 aa18.4■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 KCNA1Q09470 495 aa18.4■□□□□ 0.54
GLIS1-202ENST00000628545 CCNIQ14094 377 aa18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms