RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625245.2

SMN1-211, Transcript of survival of motor neuron 1, telomeric, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SMN1, Length 885 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1-211ENST00000625245 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.38■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 SOBPA7XYQ1 873 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 RNF40O75150 1001 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 ADRB1P08588 477 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 CCDC192P0DO97 292 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 GARTP22102 1010 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 GALK1P51570 392 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 RBP5P82980 135 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 PDGFRLQ15198 375 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 OSTM1Q86WC4 334 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 RIN3Q8TB24 985 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 CHFRQ96EP1 664 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 CYP2S1Q96SQ9 504 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 EML5Q05BV3 1969 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 STAT6P42226 847 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 CCDC142Q17RM4 750 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 KBTBD6Q86V97 674 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 ABCB6Q9NP58 842 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 PANK4Q9NVE7 773 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 ACACBO00763 2458 aa20.36■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 HCRTO43612 131 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 TADA3O75528 432 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 NOL4O94818 638 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 CKMP06732 381 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 USP17L7P0C7H9 530 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 PDCP20941 246 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 DRD1P21728 446 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 GJA4P35212 333 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 IFNAR2P48551 515 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 LHX1P48742 406 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 MTF1Q14872 753 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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SMN1-211ENST00000625245 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 CPA6Q8N4T0 437 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 EXOC4Q96A65 974 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 GDAP2Q9NXN4 497 aa20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 PCSK1P29120 753 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 FAM160A1Q05DH4 1040 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 PSMD2Q13200 908 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 ALCAMQ13740 583 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 CXorf38Q8TB03 319 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 LOXL4Q96JB6 756 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 HHIPQ96QV1 700 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 SLC22A12Q96S37 553 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 PKMYT1Q99640 499 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 ECT2Q9H8V3 914 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 SIX4Q9UIU6 781 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 WNT6Q9Y6F9 365 aa20.34■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 ATP2C2O75185 946 aa20.33■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 EPN2O95208 641 aa20.33■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 MYO1EQ12965 1108 aa20.33■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 RESTQ13127 1097 aa20.33■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 SOWAHAQ2M3V2 549 aa20.33■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 GPD1LQ8N335 351 aa20.33■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 CAMKK1Q8N5S9 505 aa20.33■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 FSIP1Q8NA03 581 aa20.33■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.33■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.33■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 MYRFLQ96LU7 910 aa20.33■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 TMEM206Q9H813 350 aa20.33■□□□□ 0.85
SMN1-211ENST00000625245 EPG5Q9HCE0 2579 aa20.33■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 KRT37O76014 449 aa20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 ZNF806P0C7X5 589 aa20.32■□□□□ 0.84
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