RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 CLEC18BQ6UXF7 455 aa12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 TMEM150AQ86TG1 271 aa12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ALLCQ8N6M5 410 aa12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 TTC9BQ8N6N2 239 aa12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 TRIML1Q8N9V2 468 aa12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 CLEC18CQ8NCF0 446 aa12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 KIF18AQ8NI77 898 aa12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ETNPPLQ8TBG4 499 aa12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 HMGB4Q8WW32 186 aa12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 FGF11Q92914 225 aa12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 TMEM176AQ96HP8 235 aa12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 SUSD3Q96L08 255 aa12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 NRSN2Q9GZP1 204 aa12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 TM7SF3Q9NS93 570 aa12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 TMEM63CQ9P1W3 806 aa12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ZMYM5Q9UJ78 669 aa12.7□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 CCDC69A6NI79 296 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA8CPA6NN73 597 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 PODXLO00592 558 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 TNFSF14O43557 240 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 MARCH6O60337 910 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ADAM23O75077 832 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 CILPO75339 1184 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 OR4Q2P0C623 313 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 CR2P20023 1033 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 CDC25CP30307 473 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ARL2P36404 184 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 LIFRP42702 1097 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 QARSP47897 775 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 CYP4A11Q02928 519 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 DUSP4Q13115 394 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 EML3Q32P44 896 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 Q4G0T1 1027 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 NFXL1Q6ZNB6 911 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 MICU3Q86XE3 530 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 NOSTRINQ8IVI9 506 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 SFTPA1Q8IWL2 248 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 OSCP1Q8WVF1 389 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 PGLYRP2Q96PD5 576 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 CSMD1Q96PZ7 3565 aa12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 MTMR11A4FU01 709 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 HIP1O00291 1037 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 N4BP3O15049 544 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 PRC1O43663 620 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 EDN1P05305 212 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 USP11P51784 963 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 TMPRSS3P57727 454 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 USP4Q13107 963 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 MTF1Q14872 753 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ZNF77Q15935 545 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 FAM187BQ17R55 369 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 XKR4Q5GH76 650 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD45Q5TZF3 282 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 CENPPQ6IPU0 288 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 C4orf19Q8IY42 314 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 TMTC2Q8N394 836 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 DDX12PQ92771 950 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 PNMA5Q96PV4 448 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 CPNE5Q9HCH3 593 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 TDP1Q9NUW8 608 aa12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 V9GY48 417 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 BRINP1O60477 761 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 SOAT2O75908 522 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 CER1O95813 267 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ATF6P18850 670 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 YWHABP31946 246 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 AVPR1AP37288 418 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ALDH1A3P47895 512 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 CLDN6P56747 220 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 PTH1RQ03431 593 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 MESP2Q0VG99 397 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 BFSP1Q12934 665 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 GPR17Q13304 367 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 TBC1D25Q3MII6 688 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ARHGAP40Q5TG30 622 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 CASC1Q6TDU7 716 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ITIH5Q86UX2 942 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 RHBDD1Q8TEB9 315 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 ATP2A3Q93084 1043 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 TMEM87BQ96K49 555 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 LPIN3Q9BQK8 851 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 GAREM1Q9H706 876 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 VAV3Q9UKW4 847 aa12.67□□□□□ -0.38
HCG18-241ENST00000602290 GDAQ9Y2T3 454 aa12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms