RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	TCF25	Q9BQ70	676 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ACBD6	Q9BR61	282 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	TLE6	Q9H808	572 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF263	O14978	683 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PJA2	O43164	708 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	B4GALT3	O60512	393 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	RTN2	O75298	545 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	TADA2A	O75478	443 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	OAZ2	O95190	189 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	KIF4A	O95239	1232 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PCSK1	P29120	753 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SLC11A1	P49279	550 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	VAV2	P52735	878 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	COL19A1	Q14993	1142 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SGO2	Q562F6	1265 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	EFHB	Q8N7U6	833 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM169	Q96HH4	297 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	TWNK	Q96RR1	684 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CDH9	Q9ULB4	789 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	VCAN	P13611	3396 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	LINC01565	O15544	149 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	THAP12	O43422	761 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	MME	P08473	750 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	FGFR3	P22607	806 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	BRCC3	P46736	316 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ERVFC1	P60507	584 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	TCEAL1	Q15170	157 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF394	Q53GI3	561 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	TFAP2B	Q92481	460 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ACP6	Q9NPH0	428 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CD207	Q9UJ71	328 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ANKRD62	A6NC57	917 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392		O00370	1275 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	FSCN2	O14926	492 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	KRT86	O43790	486 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	TBX10	O75333	385 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SETSIP	P0DME0	302 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	IL9	P15248	144 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	LMO2	P25791	158 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CYP27A1	Q02318	531 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CENPC	Q03188	943 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	KIF5A	Q12840	1032 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ADAM15	Q13444	863 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24

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