RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ITIH6Q6UXX5 1313 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR17Q8IZU2 1322 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM234BA2RU67 622 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 BTN3A1O00481 513 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 AREL1O15033 823 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D4O60343 1298 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SURF6O75683 361 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FSBPO95073 299 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ANXA1P04083 346 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MYL4P12829 197 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PTMSP20962 102 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 AFMP43652 599 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MAPKAPK2P49137 400 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXO4P98177 505 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SETQ01105 290 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CREMQ03060 361 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP3K12Q12852 859 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ADAM9Q13443 819 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MTX1Q13505 466 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB3GAP1Q15042 981 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TIGD6Q17RP2 521 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PHF19Q5T6S3 580 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 VPS53Q5VIR6 699 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FAAH2Q6GMR7 532 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CD300LDQ6UXZ3 194 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF783Q6ZMS7 281 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS1R1Q7RTX1 841 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MOGAT3Q86VF5 341 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 UNC5BQ8IZJ1 945 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM151AQ8N4L1 468 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FLCNQ8NFG4 579 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 LINS1Q8NG48 757 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 STT3BQ8TCJ2 826 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 STYXQ8WUJ0 223 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MYLIPQ8WY64 445 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ERP27Q96DN0 273 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FMNL2Q96PY5 1086 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 UNC45AQ9H3U1 944 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TRPS1Q9UHF7 1281 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 POLG2Q9UHN1 485 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MED16Q9Y2X0 877 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.658e-17■□□□□ 10.3
CAPNS1-210ENST00000590211 LRP6O75581 1613 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 UTYO14607 1347 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TTC41PQ6P2S7 1318 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 KCPQ6ZWJ8 1503 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 A6NCN8 305 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CLCA1A8K7I4 914 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 H0Y858 1186 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 GRM8O00222 908 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PODXLO00592 558 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP27B1O15528 508 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 THAP12O43422 761 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 NDST3O95803 873 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ABHD16AO95870 558 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MPOP05164 745 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MYL6BP14649 208 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PCSK1P29120 753 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 GUCY1A2P33402 732 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TUBP50607 506 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 YBX1P67809 324 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC13A2Q13183 592 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC39A6Q13433 755 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 MTM1Q13496 603 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 RTP5Q14D33 572 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB30Q15771 203 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 PROSER3Q2NL68 480 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXO47Q5MNV8 452 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 RRAGBQ5VZM2 374 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 TANGO2Q6ICL3 276 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 C16orf54Q6UWD8 224 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 UNC13DQ70J99 1090 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 CNTROBQ8N137 903 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 ESX1Q8N693 406 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 GLIS1Q8NBF1 620 aa4.73□□□□□ -1.65
CAPNS1-210ENST00000590211 SIMC1Q8NDZ2 872 aa4.73□□□□□ -1.65
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