RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 CYP27A1Q02318 531 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNC4Q03721 635 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SOWAHAQ2M3V2 549 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC44A4Q53GD3 710 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 VITQ6UXI7 678 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 KRBA2Q6ZNG9 492 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC105Q8IYK2 499 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 DTWD2Q8NBA8 298 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SYT15Q9BQS2 421 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SNX25Q9H3E2 840 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 GDAP2Q9NXN4 497 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SIT1Q9Y3P8 196 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ASB3Q9Y575 518 aa11.43□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 NCANO14594 1321 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1W2PQ27 194 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1W2PQ64 194 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A1W2PQD8 194 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 HEPACAM2A8MVW5 462 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF263O14978 683 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CALUO43852 315 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ATP2C2O75185 946 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MICAL2O94851 1124 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF202O95125 648 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 FGF19O95750 216 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 NR3C1P04150 777 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MYL1P05976 194 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PSMC3P17980 439 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CYP2F1P24903 491 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CDC25CP30307 473 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MYL6P60660 151 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SMARCB1Q12824 385 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PSMD2Q13200 908 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ANGPT1Q15389 498 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 DDR2Q16832 855 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF699Q32M78 642 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 WDR72Q3MJ13 1102 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 GAREM2Q75VX8 874 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PJA1Q8NG27 643 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 OR6B3Q8NGW1 331 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CXorf38Q8TB03 319 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MYLPFQ96A32 169 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ELMO3Q96BJ8 720 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC34Q96HJ3 373 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ACBD6Q9BR61 282 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRC3Q9BY71 257 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MMRN2Q9H8L6 949 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 TRPC7Q9HCX4 862 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.42□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 109.2
EFTUD2-209ENST00000587957 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa11.42□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 KANSL1LA0AUZ9 987 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MYBPHLA2RUH7 354 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 KIF20AO95235 890 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CST3P01034 146 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 LMO2P25791 158 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PIK3CAP42336 1068 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 RAP1GAPP47736 663 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 NUCB2P80303 420 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PRKCQQ04759 706 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 DPYDQ12882 1025 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MDH1BQ5I0G3 518 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 C4orf50Q6ZRC1 276 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 C12orf56Q8IXR9 622 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 TTC8Q8TAM2 541 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 IRF7Q92985 503 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 GPR88Q9GZN0 384 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 HSFX1Q9UBD0 423 aa11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM170BA6NMN3 283 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 PRAMEF12O95522 483 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CSH1P0DML2 217 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 CSH2P0DML3 217 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 WARSP23381 471 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 BDNFP23560 247 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 NR2F2P24468 414 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 TARSP26639 723 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 ANXA13P27216 316 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 GRIK1P39086 918 aa11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
EFTUD2-209ENST00000587957 STARD6P59095 220 aa11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms