RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570484.1

CTDNEP1-204, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTDNEP1, Length 393 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-204ENST00000570484 MICAL3Q7RTP6 2002 aa7□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 C2CD2LO14523 706 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 ARHGAP6O43182 974 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 PDGFRBP09619 1106 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 VDRP11473 427 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 CYP11B1P15538 503 aa6.99□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 PRKCIP41743 596 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 RGS19P49795 217 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 ZNF132P52740 706 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 ARPP19P56211 112 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 CDR2Q01850 454 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 CYP27A1Q02318 531 aa6.99□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 MEA1Q16626 185 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.99□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 TMC7Q7Z402 723 aa6.99□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 LRRC8AQ8IWT6 810 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 VPS52Q8N1B4 723 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 UBR7Q8N806 425 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 TSC1Q92574 1164 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 B3GALT6Q96L58 329 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 ACBD6Q9BR61 282 aa6.99□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.99□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 GABRDO14764 452 aa6.98□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 MYOGP15173 224 aa6.98□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 TNFAIP3P21580 790 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 GGCXP38435 758 aa6.98□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 NDUFV1P49821 464 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 KIF11P52732 1056 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 BCAT1P54687 386 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 RAD23BP54727 409 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 SNX16P57768 344 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 CDK17Q00537 523 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 PLCB3Q01970 1234 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 DSG1Q02413 1049 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 NR6A1Q15406 480 aa6.98□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 OSTM1Q86WC4 334 aa6.98□□□□□ -1.29
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CTDNEP1-204ENST00000570484 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDNEP1-204ENST00000570484 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.98□□□□□ -1.29
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