RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565927.1

ATP2C2-208, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 2, human

TSL 4

Gene ATP2C2, Length 548 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C2-208	ENST00000565927	TRPC3	Q13507	836 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	KCNB1	Q14721	858 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	TXNDC8	Q6A555	127 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	CPA6	Q8N4T0	437 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	RDH13	Q8NBN7	331 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	RMDN1	Q96DB5	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	SYT15	Q9BQS2	421 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	INTS13	Q9NVM9	706 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	FRYL	O94915	3013 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	DMD	P11532	3685 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927		A0A087X0B3	334 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	SOBP	A7XYQ1	873 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	ARNTL	O00327	626 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	LILRB5	O75023	590 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	CNR2	P34972	360 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	FNTB	P49356	437 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	GPR15	P49685	360 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	PSMD2	Q13200	908 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	FZD5	Q13467	585 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	RUNX3	Q13761	415 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	PDGFRL	Q15198	375 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	DPH6	Q7L8W6	267 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	MON1A	Q86VX9	555 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	LONP2	Q86WA8	852 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	WDR49	Q8IV35	697 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	BACH2	Q9BYV9	841 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	TRIM9	Q9C026	710 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	EBF3	Q9H4W6	596 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	IL21	Q9HBE4	155 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	CDH9	Q9ULB4	789 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	NCAN	O14594	1321 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	UBE4B	O95155	1302 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	ABL1	P00519	1130 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	F11	P03951	625 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	PDGFRB	P09619	1106 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927		Q6ZS52	159 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	STKLD1	Q8NE28	680 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	ATP2A3	Q93084	1043 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	CFAP45	Q9UL16	551 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	COL4A2	P08572	1712 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	ZNF292	O60281	2723 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	TRIM66	O15016	1216 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	CLIC2	O15247	247 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	BDNF	P23560	247 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	AFM	P43652	599 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	WNT7B	P56706	349 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	SPEM2	Q0P670	501 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	BIRC3	Q13489	604 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	MTF1	Q14872	753 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	VSTM1	Q6UX27	236 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	NELL1	Q92832	810 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	MYLPF	Q96A32	169 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ATP2C2-208	ENST00000565927	EXOC1	Q9NV70	894 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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