RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564136.5

KIFC3-216, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

TSL 2

Gene KIFC3, Length 3,071 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-216ENST00000564136 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 RSPH1Q8WYR4 309 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 SLCO2A1Q92959 643 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 FAM161BQ96MY7 647 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 NACC1Q96RE7 527 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 CYTH2Q99418 400 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 GPR88Q9GZN0 384 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 KCNK13Q9HB14 408 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 NDUFA13Q9P0J0 144 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 DNAJC6O75061 913 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 HOXD12P35452 270 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 GCLMP48507 274 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 STAT4Q14765 748 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 RNF207Q6ZRF8 634 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 RIN3Q8TB24 985 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 C17orf50Q8WW18 174 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 CD101Q93033 1021 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 C9orf72Q96LT7 481 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 TRABDQ9H4I3 376 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 RNF146Q9NTX7 359 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 BTBD7Q9P203 1132 aa14.59□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 TYROBPO43914 113 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 MAGEC1O60732 1142 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 COMTP21964 271 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 PCSK6P29122 969 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 FSTL1Q12841 308 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 DLG1Q12959 904 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 XKR9Q5GH70 373 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 UGT2A3Q6UWM9 527 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 TTC7BQ86TV6 843 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 SNF8Q96H20 258 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 CLPTM1LQ96KA5 538 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.58□□□□□ -0.07
KIFC3-216ENST00000564136 BRCA2P51587 3418 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 PDXKO00764 312 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 BAG2O95816 211 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 CCNE2O96020 404 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 TFAP2AP05549 437 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 UQCRBP14927 111 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 SOX5P35711 763 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 STAT1P42224 750 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 KRT72Q14CN4 511 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 LRRC6Q86X45 466 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 ARL10Q8N8L6 244 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 KAT5Q92993 513 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 PHF12Q96QT6 1004 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 FIZ1Q96SL8 496 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 GGA3Q9NZ52 723 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 ASIC3Q9UHC3 531 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.58□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 A0A0G2JND7 137 aa14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 ANKRD62A6NC57 917 aa14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 PIK3CAP42336 1068 aa14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 ACTR3P61158 418 aa14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 NR1H3Q13133 447 aa14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 MED21Q13503 144 aa14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 FYB2Q5VWT5 728 aa14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.083e-6■■■■□ 21.3
KIFC3-216ENST00000564136 PFDN4Q9NQP4 134 aa14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 PLA2G4CQ9UP65 541 aa14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 TMEM247A6NEH6 219 aa14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 AP1G1O43747 822 aa14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 ZBED4O75132 1171 aa14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 BCRP11274 1271 aa14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
KIFC3-216ENST00000564136 CPA2P48052 419 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms