RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 MED26O95402 600 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 NPTXRO95502 500 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 TGFB1P01137 390 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 IGLV1-40P01703 118 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CTAGE8P0CG41 777 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 PTPRAP18433 802 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 HLA-DPA1P20036 260 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 MX1P20591 662 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 TRIM23P36406 574 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 LIFRP42702 1097 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ACADSBP45954 432 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 MYL6P60660 151 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 UBE2HP62256 183 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CSNK2BP67870 215 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 TNFAIP2Q03169 654 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 INSCQ1MX18 579 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF674Q2M3X9 581 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 LRIT3Q3SXY7 679 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ARL13BQ3SXY8 428 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 USH1GQ495M9 461 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 IGSF11Q5DX21 431 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 XKR3Q5GH77 459 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC62Q6P9F0 684 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CLEC2AQ6UVW9 174 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 IL27RAQ6UWB1 636 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CTAGE6Q86UF2 777 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 STK32CQ86UX6 486 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 HEATR4Q86WZ0 1026 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CREG2Q8IUH2 290 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CTAGE4Q8IX94 777 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 FAM20CQ8IXL6 584 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 NIPA2Q8N8Q9 360 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ANKS4BQ8N8V4 417 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 C1orf127Q8N9H9 656 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 GOLM1Q8NBJ4 401 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ZMIZ2Q8NF64 920 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 UBASH3BQ8TF42 649 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 COG1Q8WTW3 980 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 HERVK_113Q902F9 699 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CUL5Q93034 780 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 FAM149B1Q96BN6 582 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CABS1Q96KC9 395 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 SNX27Q96L92 541 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 COQ7Q99807 217 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 TSG101Q99816 390 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 DHRS4Q9BTZ2 278 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 KIFC3Q9BVG8 833 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CEP41Q9BYV8 373 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 UCK1Q9HA47 277 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 SCPEP1Q9HB40 452 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 WASH6PQ9NQA3 447 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ANO10Q9NW15 660 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 SLC39A1Q9NY26 324 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 SALL4Q9UJQ4 1053 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 PALD1Q9ULE6 856 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 DNM3Q9UQ16 869 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 A2ML1A8K2U0 1454 aa5.83□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 MYPNQ86TC9 1320 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 A0A1B0GUA9 196 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 A0A1W2PPH5 198 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 MAGEB16A2A368 324 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 PGPEP1LA6NFU8 196 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 A6NNZ2 444 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 TM4SF5O14894 197 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 NPC1O15118 1278 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CTIFO43310 598 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 FMO6PO60774 539 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 NOL3O60936 208 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ADAM11O75078 769 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CBFA2T3O75081 653 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 FLOT1O75955 427 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 FGF18O76093 207 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 PAPLNO95428 1278 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CHRNA1P02708 482 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 POLBP06746 335 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 CTNNA2P26232 953 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 GCKP35557 465 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 TUBP50607 506 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 SLC12A3P55017 1021 aa5.82□□□□□ -1.48
CAPN3-211ENST00000562199 OXCT1P55809 520 aa5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms