RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	C8orf49	Q96NF6	230 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	PNPO	Q9NVS9	261 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	STK32B	Q9NY57	414 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	JAG2	Q9Y219	1238 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	UTY	O14607	1347 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	COL15A1	P39059	1388 aa		5.38	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	CACNA1F	O60840	1977 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934		A6NNZ2	444 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	F2RL2	O00254	374 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	SLC16A6	O15403	523 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	PJA2	O43164	708 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	TUSC2	O75896	110 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	POMC	P01189	267 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	GNAI2	P04899	355 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	CD1A	P06126	327 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	GNAI3	P08754	354 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	GYS1	P13807	737 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	TM4SF1	P30408	202 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	SCNN1G	P51170	649 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	RABGGTB	P53611	331 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	SUCLG2	Q96I99	432 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	MNT	Q99583	582 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	NDC1	Q9BTX1	674 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	GPR87	Q9BY21	358 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	STAP2	Q9UGK3	403 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	ATP10D	Q9P241	1426 aa		5.37	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	TYR	P14679	529 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	SLC6A2	P23975	617 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	SLC6A4	P31645	630 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	PLS1	Q14651	629 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	ATP2B3	Q16720	1220 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	CEP85	Q6P2H3	762 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	NPNT	Q6UXI9	565 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	MED25	Q71SY5	747 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	DGKH	Q86XP1	1220 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	SYT12	Q8IV01	421 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	PALM2	Q8IXS6	379 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	NT5C1B	Q96P26	610 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	C4B	P0C0L5	1744 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		5.36	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	XDH	P47989	1333 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	DRGX	A6NNA5	263 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	LEFTY2	O00292	366 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	PRSS23	O95084	383 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	ARIH2	O95376	493 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	NTSR2	O95665	410 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	AMH	P03971	560 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	SERPINB2	P05120	415 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	PRDX5	P30044	214 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	PHKA1	P46020	1223 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	CHN2	P52757	468 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	DDR1	Q08345	913 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	CRHR2	Q13324	411 aa		5.35	□□□□□ -1.55
LINS1-210	ENST00000560934	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55

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