RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560715.5

TSPAN3-209, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 2,892 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-209ENST00000560715 GSTA2P09210 222 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 KITP10721 976 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 YY1P25490 414 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 BPIFB4P59827 614 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 UBXN1Q04323 297 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 KLC1Q07866 573 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 ARL13BQ3SXY8 428 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 DGKKQ5KSL6 1271 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 CHST14Q8NCH0 376 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM81BQ96LP2 452 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 FSD1Q9BTV5 496 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 ABHD10Q9NUJ1 306 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 KCTD5Q9NXV2 234 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 CIDEBQ9UHD4 219 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 PAPPAQ13219 1627 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 E7ENQ6 273 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 ADAMTS3O15072 1205 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 WFS1O76024 890 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 LPLP06858 475 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 VCAM1P19320 739 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 PCK1P35558 622 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 AFMP43652 599 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 CACNB3P54284 484 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 NLRP5P59047 1200 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 KCNJ2P63252 427 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 KIF5AQ12840 1032 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 CBX3Q13185 183 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC39A6Q13433 755 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM110CQ1W6H9 321 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 CT83Q5H943 113 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 EPHX4Q8IUS5 362 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 CORO1BQ9BR76 489 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 BRD8Q9H0E9 1235 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 VCX3BQ9H321 246 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 VCX3AQ9NNX9 186 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 ADAM22Q9P0K1 906 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 APOL1O14791 398 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 FGF18O76093 207 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 ADH1CP00326 375 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 GNAZP19086 355 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 PRKAA2P54646 552 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 CABP4P57796 275 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 KRT83P78385 493 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 GUCY1B3Q02153 619 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC35G1Q2M3R5 365 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 MAJINQ3KP22 176 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 RRAGBQ5VZM2 374 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 OXR1Q8N573 874 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM227BQ96M60 508 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 NEK1Q96PY6 1258 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 ADPGKQ9BRR6 497 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 DENND2AQ9ULE3 1009 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN3-209ENST00000560715 GLI3P10071 1580 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms