RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556416.1

CLMN-205, Transcript of calmin, humanhuman

TSL 2

Gene CLMN, Length 1,772 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMN-205ENST00000556416 FUKQ8N0W3 1084 aa24.84■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa24.84■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 TMEM169Q96HH4 297 aa24.84■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 PKMYT1Q99640 499 aa24.84■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 TTPALQ9BTX7 342 aa24.84■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 AAASQ9NRG9 546 aa24.84■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa24.84■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 CLDN5O00501 218 aa24.83■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 LINC00271P0C7V0 271 aa24.83■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 GPD2P43304 727 aa24.83■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 CDR1P51861 262 aa24.83■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 ZNF280DQ6N043 979 aa24.83■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 ARHGEF26Q96DR7 871 aa24.83■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 PCED1BQ96HM7 432 aa24.83■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 C11orf70Q9BRQ4 267 aa24.83■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 MED10Q9BTT4 135 aa24.83■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 B3GNT5Q9BYG0 378 aa24.83■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 NCANO14594 1321 aa24.83■■□□□ 1.57
CLMN-205ENST00000556416 LCHNA4D1U4 455 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 CTXN3Q4LDR2 81 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 C2CD6Q53TS8 623 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 FAM171BQ6P995 826 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 PAQR9Q6ZVX9 377 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 ANKRD52Q8NB46 1076 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 MYLPFQ96A32 169 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 ZNF653Q96CK0 615 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 ADAM22Q9P0K1 906 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 MMP8P22894 467 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 PPM1AP35813 382 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 BCAT1P54687 386 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 GPC5P78333 572 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 PTP4A2Q12974 167 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 SHHQ15465 462 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 USP41Q3LFD5 358 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 NYAP1Q6ZVC0 841 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 LRRTM3Q86VH5 581 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 TMLHEQ9NVH6 421 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 SALL4Q9UJQ4 1053 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa24.82■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 BTNL10A8MVZ5 291 aa24.81■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 PLCB3Q01970 1234 aa24.81■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 PDE4CQ08493 712 aa24.81■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 BST2Q10589 180 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 PDCLQ13371 301 aa24.81■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 PTPN20Q4JDL3 420 aa24.81■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 FAM35AQ86V20 835 aa24.81■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 ERICH1Q86X53 443 aa24.81■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 TRIM11Q96F44 468 aa24.81■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa24.81■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa24.81■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 CEP290O15078 2479 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 H7C4K7 107 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 SOD2P04179 222 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 OR4Q2P0C623 313 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 SETSIPP0DME0 302 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 RABGGTBP53611 331 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 PTPN14Q15678 1187 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 ANKS3Q6ZW76 656 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 RFFLQ8WZ73 363 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 NOX5Q96PH1 765 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 CPXM1Q96SM3 734 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 MYO1AQ9UBC5 1043 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 OR6C75A6NL08 312 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 TULP2O00295 520 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 MYBL1P10243 752 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 DUSP16Q9BY84 665 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 CHST7Q9NS84 486 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 KRT82Q9NSB4 513 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 PATJQ8NI35 1801 aa24.8■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 CYP1A2P05177 515 aa24.79■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 CALB1P05937 261 aa24.79■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 RRM1P23921 792 aa24.79■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 SLC39A12Q504Y0 691 aa24.79■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 MSANTD4Q8NCY6 345 aa24.79■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 SLC35F5Q8WV83 523 aa24.79■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 TJP2Q9UDY2 1190 aa24.79■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 BUB1O43683 1085 aa24.78■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 KIF5CO60282 957 aa24.78■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 TBC1D4O60343 1298 aa24.78■■□□□ 1.56
CLMN-205ENST00000556416 MOCS3O95396 460 aa24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms