RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553628.1

AC009396.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009396.1, Length 1,079 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009396.1-201ENST00000553628 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
AC009396.1-201ENST00000553628 RLIMQ9NVW2 624 aa6.65□□□□□ -1.34
AC009396.1-201ENST00000553628 STK32BQ9NY57 414 aa6.65□□□□□ -1.34
AC009396.1-201ENST00000553628 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.65□□□□□ -1.34
AC009396.1-201ENST00000553628 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.65□□□□□ -1.34
AC009396.1-201ENST00000553628 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa6.65□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa6.65□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 OVOS2Q6IE36 1432 aa6.65□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 FZD7O75084 574 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 TUSC2O75896 110 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 SPDEFO95238 335 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 ABHD16AO95870 558 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 MAKP20794 623 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 ACVRL1P37023 503 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 PHKA1P46020 1223 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 ABHD18Q0P651 414 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 KIF22Q14807 665 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 Q6ZPA2 131 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 SMIM5Q71RC9 77 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 C14orf80Q86SX3 495 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 PDSS2Q86YH6 399 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 PDPRQ8NCN5 879 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 NACC2Q96BF6 587 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 BRD9Q9H8M2 597 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 ARMT1Q9H993 441 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 QSER1Q2KHR3 1735 aa6.64□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 A0A088AWK7 358 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 A6NNZ2 444 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF785A8K8V0 405 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 ANXA1P04083 346 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 HLA-DOAP06340 250 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 GNAI3P08754 354 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 MCM7P33993 719 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 GNAI1P63096 354 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 SCAPQ12770 1279 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 TP53BP2Q13625 1128 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 CYP2A13Q16696 494 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF627Q7L945 461 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 SCAMP4Q969E2 229 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 RNF31Q96EP0 1072 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 LRIG1Q96JA1 1093 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 NT5C1BQ96P26 610 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 GPR35Q9HC97 309 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 STAP2Q9UGK3 403 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.63□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 COL18A1P39060 1754 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 VSTM5A8MXK1 200 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 ERC2O15083 957 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 PPFIA4O75335 1185 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 CDKL5O76039 1030 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 ADH4P08319 380 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 RARBP10826 455 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 KLF10Q13118 480 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 TTC8Q8TAM2 541 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 ASB10Q8WXI3 467 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 MED15Q96RN5 788 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 RNF181Q9P0P0 153 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 MAP3K5Q99683 1374 aa6.61□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 FSHBP01225 129 aa6.61□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 KRT4P19013 534 aa6.61□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 HDCP19113 662 aa6.61□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 GUCY1B3Q02153 619 aa6.61□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 GEN1Q17RS7 908 aa6.61□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.61□□□□□ -1.35
AC009396.1-201ENST00000553628 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms