RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	TM4SF5	O14894	197 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	HCRT	O43612	131 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ATG13	O75143	517 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	NOL4	O94818	638 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF806	P0C7X5	589 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	CSH1	P0DML2	217 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	CSH2	P0DML3	217 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	GJA4	P35212	333 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	PNPLA4	P41247	253 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	GALK1	P51570	392 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	CASP5	P51878	434 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	LIMK1	P53667	647 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	MTF1	Q14872	753 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ST3GAL2	Q16842	350 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	IL31	Q6EBC2	164 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	BRAP	Q7Z569	592 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	OSTM1	Q86WC4	334 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	CXorf38	Q8TB03	319 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	LOXL4	Q96JB6	756 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		13.53	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		13.52	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		13.52	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		13.52	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	IGF2R	P11717	2491 aa		13.52	□□□□□ -0.24
LETMD1-231	ENST00000551931	MYMK	A6NI61	221 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	SOBP	A7XYQ1	873 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	USP4	Q13107	963 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	POSTN	Q15063	836 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	PDGFRL	Q15198	375 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF77	Q15935	545 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	TTC16	Q8NEE8	873 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	MYRFL	Q96LU7	910 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ACBD6	Q9BR61	282 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ABCB6	Q9NP58	842 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	STK17A	Q9UEE5	414 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CLIC4	Q9Y696	253 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	HUS1	O60921	280 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	AKAP3	O75969	853 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	GCNT3	O95395	438 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	DRD1	P21728	446 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	MPL	P40238	635 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	MYL7	Q01449	175 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	PLK5	Q496M5	336 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	STPG1	Q5TH74	334 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CPA6	Q8N4T0	437 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	TCEAL3	Q969E4	200 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ACCS	Q96QU6	501 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	SIX4	Q9UIU6	781 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		13.51	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	PTPRJ	Q12913	1337 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	C2orf78	A6NCI8	922 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	DCLK1	O15075	740 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CKM	P06732	381 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	GAP43	P17677	238 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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