RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 MICAL2O94851 1124 aa24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 CDR2Q01850 454 aa24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 LRIT3Q3SXY7 679 aa24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM30AQ9NV96 361 aa24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 TSC2P49815 1807 aa24.13■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR27A2RRH5 827 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 OR6C75A6NL08 312 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 VNN2O95498 520 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC172P0C7W6 258 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 SPATA31D3P0C874 917 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 ROR1Q01973 937 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 RAD9BQ6WBX8 426 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 TTC30AQ86WT1 665 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 BACE2Q9Y5Z0 518 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 TULP2O00295 520 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 SOAT2O75908 522 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 BEST1O76090 585 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 BDNFP23560 247 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC8B1Q6J4K2 584 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 CRISPLD1Q9H336 500 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF576Q9H609 170 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 TAS2R14Q9NYV8 317 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa24.12■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A087X0T9 212 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 C2orf71A6NGG8 1288 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 M0QYV0 167 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM228BP0C875 321 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 TNFAIP3P21580 790 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP2F1P24903 491 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 CCZ1BP86790 482 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 CNGA2Q16280 664 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP26C1Q6V0L0 522 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 LRCH3Q96II8 777 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 DEF6Q9H4E7 631 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 FECHP22830 423 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC30A5Q8TAD4 765 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC42Q96M95 316 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT82Q9NSB4 513 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA1257Q9ULG3 409 aa24.11■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 MYO7AQ13402 2215 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 PER2O15055 1255 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 UBE3AQ05086 875 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 ADCY1Q08828 1119 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 C2CD6Q53TS8 623 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP17Q68EM7 881 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 LCLAT1Q6UWP7 414 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM35AQ86V20 835 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 WDTC1Q8N5D0 677 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 STKLD1Q8NE28 680 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNK16Q96T55 309 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 CYTH4Q9UIA0 394 aa24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 PIK3R2O00459 728 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 FSCN2O14926 492 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 LPXNO60711 386 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR15P49685 360 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR17Q13304 367 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 SDHAF4Q5VUM1 108 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 NAA35Q5VZE5 725 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 FMNL3Q8IVF7 1028 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM161BQ96MY7 647 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL5Q96PQ7 755 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 MTMR11A4FU01 709 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 AKR1B10O60218 316 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF11P52732 1056 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 CDK17Q00537 523 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 DUSP4Q13115 394 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 TMTC1Q8IUR5 882 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 DESI2Q9BSY9 194 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 RXFP1Q9HBX9 757 aa24.09■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1W2PPC1 479 aa24.08■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF263O14978 683 aa24.08■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 MED7O43513 233 aa24.08■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 AP1G2O75843 785 aa24.08■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP3K7CLP57077 242 aa24.08■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 PDE4CQ08493 712 aa24.08■■□□□ 1.45
TSNARE1-208ENST00000524325 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms