RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-205ENST00000519846 LMCD1Q9NZU5 365 aa5.3□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 L1RE1Q9UN81 338 aa5.3□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 LZTS1Q9Y250 596 aa5.3□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 CACNA1HO95180 2353 aa5.3□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 MYO10Q9HD67 2058 aa5.3□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.3□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 BDNFP23560 247 aa5.3□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 VN1R2Q8NFZ6 395 aa5.3□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 PARD3BQ8TEW8 1205 aa5.3□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 SIRPGQ9P1W8 387 aa5.3□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa5.3□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 JUNDP17535 347 aa5.3□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 NOP14P78316 857 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 PSMD6Q15008 389 aa5.3□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 PTPN21Q16825 1174 aa5.3□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 CCDC183Q5T5S1 534 aa5.3□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 FLCNQ8NFG4 579 aa5.3□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 ST7Q9NRC1 585 aa5.3□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa5.3□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 CHD9Q3L8U1 2897 aa5.3□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 TRIP11Q15643 1979 aa5.3□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa5.29□□□□□ -1.56
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CLVS1-205ENST00000519846 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 COX20Q5RI15 118 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 KRT39Q6A163 491 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 PDXDC1Q6P996 788 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 OSTM1Q86WC4 334 aa5.29□□□□□ -1.56
CLVS1-205ENST00000519846 OR10T2Q8NGX3 314 aa5.29□□□□□ -1.56
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