RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514893.5

NEDD4-211, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4-211	ENST00000514893	USP1	O94782	785 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	GNAI2	P04899	355 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	EDNRB	P24530	442 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	MASP1	P48740	699 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	GPSM2	P81274	684 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	KIF22	Q14807	665 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	POLH	Q9Y253	713 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	FCHO1	O14526	889 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	ARIH2	O95376	493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	FES	P07332	822 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	C5AR1	P21730	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	KAT5	Q92993	513 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEDD4-211	ENST00000514893	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	EXOC3	O60645	756 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	ALPL	P05186	524 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	CLCN2	P51788	898 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	GHRHR	Q02643	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	C3orf20	Q8ND61	904 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	COA7	Q96BR5	231 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893		A1L4Q6	167 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	TJP3	O95049	919 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	PRF1	P14222	555 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	PRDX5	P30044	214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	PHKA1	P46020	1223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	THBS3	P49746	956 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	NPY5R	Q15761	445 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893		Q6ZWC4	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	FZD9	O00144	591 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	ABLIM3	O94929	683 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	CNGA1	P29973	690 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	TPTE	P56180	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	DSC2	Q02487	901 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	GLG1	Q92896	1179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	WDCP	Q9H6R7	721 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	A1BG	P04217	495 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	E2F2	Q14209	437 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEDD4-211	ENST00000514893	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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