RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 POLE2P56282 527 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1B-205ENST00000514178 LILRA4P59901 499 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1B-205ENST00000514178 KRT17Q04695 432 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1B-205ENST00000514178 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
PGGT1B-205ENST00000514178 GRM7Q14831 915 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF750Q32MQ0 723 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1B-205ENST00000514178 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
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PGGT1B-205ENST00000514178 TAF2Q6P1X5 1199 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1B-205ENST00000514178 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1B-205ENST00000514178 PLEKHH3Q7Z736 793 aa8.97□□□□□ -0.97
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PGGT1B-205ENST00000514178 ASB12Q8WXK4 309 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1B-205ENST00000514178 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PGGT1B-205ENST00000514178 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
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PGGT1B-205ENST00000514178 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PGGT1B-205ENST00000514178 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PGGT1B-205ENST00000514178 SWAP70Q9UH65 585 aa8.97□□□□□ -0.97
PGGT1B-205ENST00000514178 B9A039 149 aa8.96□□□□□ -0.98
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PGGT1B-205ENST00000514178 POLBP06746 335 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 CST5P28325 142 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
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PGGT1B-205ENST00000514178 METTL24Q5JXM2 366 aa8.96□□□□□ -0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC30A10Q6XR72 485 aa8.96□□□□□ -0.98
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PGGT1B-205ENST00000514178 TMTC1Q8IUR5 882 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 BPIFB1Q8TDL5 484 aa8.95□□□□□ -0.98
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PGGT1B-205ENST00000514178 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 FEM1BQ9UK73 627 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 RAD54BQ9Y620 910 aa8.95□□□□□ -0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 TISP43B9A030 160 aa8.94□□□□□ -0.98
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PGGT1B-205ENST00000514178 SATB1Q01826 763 aa8.94□□□□□ -0.98
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PGGT1B-205ENST00000514178 C2CD5Q86YS7 1000 aa8.94□□□□□ -0.98
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PGGT1B-205ENST00000514178 OR14A2Q96R54 314 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 PNKPQ96T60 521 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 RTKNQ9BST9 563 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.94□□□□□ -0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-205ENST00000514178 DNPH1O43598 174 aa8.93□□□□□ -0.98
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