RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513272.5

TMA16-209, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMA16, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16-209ENST00000513272 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 LMNAP02545 664 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 PDGFRBP09619 1106 aa20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 AVPR1AP37288 418 aa20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 SOX9P48436 509 aa20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 MTAPQ13126 283 aa20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 FAM171BQ6P995 826 aa20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 ZNF516Q92618 1163 aa20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 LMAN1LQ9HAT1 526 aa20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 CDH9Q9ULB4 789 aa20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 CFAP54Q96N23 3096 aa20.32■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 COL4A2P08572 1712 aa20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 PSMD2Q13200 908 aa20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 TRPC3Q13507 836 aa20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 ZNF528Q3MIS6 628 aa20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 TXNDC8Q6A555 127 aa20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 USP25Q9UHP3 1055 aa20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 HPSEQ9Y251 543 aa20.31■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 PHACTR2O75167 634 aa20.3■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 NOL4O94818 638 aa20.3■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 CASP4P49662 377 aa20.3■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 TNNC1P63316 161 aa20.3■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 PLCB2Q00722 1185 aa20.3■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 TSSK4Q6SA08 328 aa20.3■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 MYLPFQ96A32 169 aa20.3■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 MSANTD3Q96H12 275 aa20.3■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 CHRDQ9H2X0 955 aa20.3■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 SNX25Q9H3E2 840 aa20.3■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 CCL26Q9Y258 94 aa20.3■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 FAM186AA6NE01 2351 aa20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 CHRNB1P11230 501 aa20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 MAGEA11P43364 429 aa20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 SYKP43405 635 aa20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 MYL6P60660 151 aa20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 CYP27A1Q02318 531 aa20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 TNK2Q07912 1038 aa20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 C1orf228Q6PIY5 440 aa20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 MON1AQ86VX9 555 aa20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 MYRFLQ96LU7 910 aa20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 GKN1Q9NS71 199 aa20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 TDP1Q9NUW8 608 aa20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.29■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 KINO60870 393 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 TACC1O75410 805 aa20.28■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 TADA3O75528 432 aa20.28■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 MYL1P05976 194 aa20.28■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 BDNFP23560 247 aa20.28■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 CTHP32929 405 aa20.28■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 GRIK1P39086 918 aa20.28■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 NDUFA8P51970 172 aa20.28■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 BIRC3Q13489 604 aa20.28■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 TXNDC11Q6PKC3 985 aa20.28■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.28■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.28■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.28■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 PATJQ8NI35 1801 aa20.27■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 SOBPA7XYQ1 873 aa20.27■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 CLSTN1O94985 981 aa20.27■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.27■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.27■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 VSTM1Q6UX27 236 aa20.27■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.27■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.27■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 PCED1BQ96HM7 432 aa20.27■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 IER2Q9BTL4 223 aa20.27■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TMA16-209ENST00000513272 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.8 ms