RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 OR51B5Q9H339 312 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 NFU1Q9UMS0 254 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 LAMC1P11047 1609 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ADCY10Q96PN6 1610 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 KDM6BO15054 1643 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ADGRL2O95490 1459 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 DNAJC6O75061 913 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ENTPD5O75356 428 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SULT1C4O75897 302 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 GJB6O95452 261 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CALB1P05937 261 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 JAK1P23458 1154 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PCSK6P29122 969 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 IDUAP35475 653 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 IFNAR2P48551 515 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGDIAP52565 204 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 HK2P52789 917 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CD300CQ08708 224 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ATP1A4Q13733 1029 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 AAGABQ6PD74 315 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 IPMKQ8NFU5 416 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 GANCQ8TET4 914 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TAMM41Q96BW9 452 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 YME1L1Q96TA2 773 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SNTG2Q9NY99 539 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SPG7Q9UQ90 795 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PLOD2O00469 737 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 RASGRF2O14827 1237 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 MTSS1O43312 755 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PRKCIP41743 596 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PCP4P48539 62 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PTPN5P54829 565 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SLC12A2P55011 1212 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 VCPP55072 806 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 STX3Q13277 289 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM16LQ309B1 348 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 MAJINQ3KP22 176 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ARSHQ5FYA8 562 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 DUPD1Q68J44 220 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 OR6S1Q8NH40 331 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC51Q96ER9 411 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC1Q9BTT6 524 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 GON7Q9BXV9 100 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CSRNP2Q9H175 543 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF69Q9UC07 566 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 VWA7Q9Y334 891 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PDE8AO60658 829 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SHBGP04278 402 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 GAP43P17677 238 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CYP3A7P24462 503 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PON1P27169 355 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 MARK3P27448 753 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 POU3F4P49335 361 aa6.44□□□□□ -1.38
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