RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491123.5

SUCLG1-208, Transcript of succinate-CoA ligase alpha subunit, human

TSL 3

Gene SUCLG1, Length 1,073 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	PIP4P1	Q86T03	277 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	COG1	Q8WTW3	980 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	KAT5	Q92993	513 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	PROCR	Q9UNN8	238 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123		K7ESF4	209 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	PDE1A	P54750	535 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	UBXN4	Q92575	508 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	JADE3	Q92613	823 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	ENPP3	O14638	875 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	GPR39	O43194	453 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	PDE8B	O95263	885 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	GNAI3	P08754	354 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	C5AR1	P21730	350 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	SOX5	P35711	763 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	PHKA1	P46020	1223 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	KCNJ5	P48544	419 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	GNAI1	P63096	354 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	CCDC154	A6NI56	674 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRSS44	E7EML9	344 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	USP1	O94782	785 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	TJP3	O95049	919 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123		Q6ZWC4	215 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	SIK2	Q9H0K1	926 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	EXOC3	O60645	756 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	RARB	P10826	455 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	KRT10	P13645	584 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC16A1	P53985	500 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	KIF22	Q14807	665 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	CLUL1	Q15846	466 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	USP37	Q86T82	979 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	TERB1	Q8NA31	727 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	SNX18	Q96RF0	628 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	DSCR3	O14972	297 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	GLG1	Q92896	1179 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SUCLG1-208	ENST00000491123		A1L4Q6	167 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	TOMM40	O96008	361 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	RENBP	P51606	427 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	GPSM2	P81274	684 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	DSC2	Q02487	901 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	6.21	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	R3HDM4	Q96D70	268 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	DRC1	Q96MC2	740 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	TRMO	Q9BU70	441 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	DCLK1	O15075	740 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	MT3	P25713	68 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	GHRHR	Q02643	423 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	NPY5R	Q15761	445 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF398	Q8TD17	642 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	CUL5	Q93034	780 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	GLOD4	Q9HC38	313 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	ERC2	O15083	957 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	KRT86	O43790	486 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	A1BG	P04217	495 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	PSG1	P11464	419 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRDX5	P30044	214 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	PIK3CG	P48736	1102 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	KRT81	Q14533	505 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SUCLG1-208	ENST00000491123	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42

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