RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA17	Q96L03	361 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPRJ	Q12913	1337 aa		18.49	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	NOL4	O94818	638 aa		18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	GDI1	P31150	447 aa		18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	VIPR2	P41587	438 aa		18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP2J2	P51589	502 aa		18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR158	Q5T848	1215 aa		18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	YAF2	Q8IY57	180 aa		18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	TMC2	Q8TDI7	906 aa		18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		18.48	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	MBD3	O95983	291 aa		18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	GJA1	P17302	382 aa		18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	NLRP12	P59046	1061 aa		18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPC3	Q13507	836 aa		18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	MON1A	Q86VX9	555 aa		18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	RDH13	Q8NBN7	331 aa		18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA20	Q8TB22	786 aa		18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	TAF4B	Q92750	862 aa		18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	TSG101	Q99816	390 aa		18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXQ1	Q9C009	403 aa		18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	TSC2	P49815	1807 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	SHISA7	A6NL88	538 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	GFRA3	O60609	400 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	SOAT2	O75908	522 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	PTMS	P20962	102 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP3CC	P48454	512 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE6C	P51160	858 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	FZD5	Q13467	585 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	CAMK4	Q16566	473 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	OSTM1	Q86WC4	334 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF516	Q92618	1163 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	SYT15	Q9BQS2	421 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		18.46	■□□□□ 0.55
HDAC10-216	ENST00000489424	COL4A3	Q01955	1670 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMA7	O14818	248 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	AVPR1A	P37288	418 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	TNNC1	P63316	161 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	GRM2	Q14416	872 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	GIPC2	Q8TF65	315 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM3C	Q92520	227 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	MMS19	Q96T76	1030 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX25	Q9H3E2	840 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		18.45	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR23A	A6NEV1	266 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM66	O15016	1216 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	LAMTOR5	O43504	91 aa		18.44	■□□□□ 0.54
HDAC10-216	ENST00000489424	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	18.44	■□□□□ 0.54

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