RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
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USP40-215ENST00000484528 TADA3O75528 432 aa23.11■■□□□ 1.29
USP40-215ENST00000484528 DLATP10515 647 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
USP40-215ENST00000484528 PCSK1P29120 753 aa23.11■■□□□ 1.29
USP40-215ENST00000484528 AFMP43652 599 aa23.11■■□□□ 1.29
USP40-215ENST00000484528 LHX1P48742 406 aa23.11■■□□□ 1.29
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USP40-215ENST00000484528 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.11■■□□□ 1.29
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USP40-215ENST00000484528 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa23.11■■□□□ 1.29
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USP40-215ENST00000484528 IER2Q9BTL4 223 aa23.11■■□□□ 1.29
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USP40-215ENST00000484528 GKN1Q9NS71 199 aa23.11■■□□□ 1.29
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USP40-215ENST00000484528 SPATA18Q8TC71 538 aa23.1■■□□□ 1.29
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USP40-215ENST00000484528 C1orf228Q6PIY5 440 aa23.09■■□□□ 1.29
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USP40-215ENST00000484528 CDH9Q9ULB4 789 aa23.07■■□□□ 1.28
USP40-215ENST00000484528 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
USP40-215ENST00000484528 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa23.06■■□□□ 1.28
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USP40-215ENST00000484528 WARSP23381 471 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
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USP40-215ENST00000484528 NRLP54845 237 aa23.06■■□□□ 1.28
USP40-215ENST00000484528 CYP27A1Q02318 531 aa23.06■■□□□ 1.28
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