RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 CDH9Q9ULB4 789 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 R4GN57 208 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 DMDP11532 3685 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 NCAM2O15394 837 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 MYL1P05976 194 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 WEE1P30291 646 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 MYL6P60660 151 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 TRPC3Q13507 836 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 TXNDC8Q6A555 127 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 CMTM8Q8IZV2 173 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 MYLPFQ96A32 169 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 DMAC2Q9NW81 257 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 OBP2AQ9NY56 170 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 NME7Q9Y5B8 376 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 LAMTOR5O43504 91 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 PHACTR2O75167 634 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 NOL4O94818 638 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 CCNE1P24864 410 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 SOX9P48436 509 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 TNNC1P63316 161 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 SNX25Q9H3E2 840 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 CCL26Q9Y258 94 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 A0A1W2PQ27 194 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 A0A1W2PQ64 194 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 A0A1W2PQD8 194 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 PDXKO00764 312 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 TACC1O75410 805 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 TADA3O75528 432 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 NR3C1P04150 777 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 BDNFP23560 247 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 AVPR1AP37288 418 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 MAGEA9P43362 315 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 CYP27A1Q02318 531 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 DPYDQ12882 1025 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 BIRC3Q13489 604 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 PCED1BQ96HM7 432 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-211ENST00000482015 COL4A2P08572 1712 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 ATICP31939 592 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 MAGEA11P43364 429 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 DLG4P78352 724 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 TNK2Q07912 1038 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 MTAPQ13126 283 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 MON1AQ86VX9 555 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 MYRFLQ96LU7 910 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 LMAN1LQ9HAT1 526 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 RHOBTB3O94955 611 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 CLSTN1O94985 981 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 ZNF202O95125 648 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 STAU1O95793 577 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 GRIK1P39086 918 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 CLDN10P78369 228 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 CEP135Q66GS9 1140 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 TSSK4Q6SA08 328 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 TDP1Q9NUW8 608 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 FBXO4Q9UKT5 387 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 VPS13AQ96RL7 3174 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-211ENST00000482015 A8MXQ7 604 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms