RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 A0A1W2PRU2 124 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 PRR33A8MZF0 331 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 FGF19O95750 216 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 GJA1P17302 382 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 GPR15P49685 360 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 PARM1Q6UWI2 310 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 PATJQ8NI35 1801 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 MOSPD3O75425 235 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 GABRR2P28476 465 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 MAGEA11P43364 429 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 TEAD2Q15562 447 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 DDR2Q16832 855 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 CBWD6Q4V339 395 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 SLC35C1Q96A29 364 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 TNIP3Q96KP6 325 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 GCNAQ96QF7 691 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 LRFN3Q9BTN0 628 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.18■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 TMEM221A6NGB7 291 aa22.17■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 M0R296 226 aa22.17■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 CSH1P0DML2 217 aa22.17■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 CSH2P0DML3 217 aa22.17■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 BDNFP23560 247 aa22.17■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.17■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 VSTM1Q6UX27 236 aa22.17■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.17■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 STKLD1Q8NE28 680 aa22.17■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 BCO2Q9BYV7 579 aa22.17■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 RAB20Q9NX57 234 aa22.17■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 KMT2EQ8IZD2 1858 aa22.17■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.17■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 NARSO43776 548 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 GAREM2Q75VX8 874 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 MLKLQ8NB16 471 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 SEMA4DQ92854 862 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 ASIC4Q96FT7 647 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 KXD1Q9BQD3 176 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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NELFE-208ENST00000481121 LRRN2O75325 713 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 GNA14O95837 355 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 SRFP11831 508 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 CDC25CP30307 473 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 NDST1P52848 882 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 POTEHQ6S545 545 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 GPT2Q8TD30 523 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 ASB16Q96NS5 453 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 GPR88Q9GZN0 384 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.16■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 ATP8B3O60423 1300 aa22.15■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 ANXA13P27216 316 aa22.15■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 GRIK1P39086 918 aa22.15■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 INCA1Q0VD86 236 aa22.15■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.15■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 WDR44Q5JSH3 913 aa22.15■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.15■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.15■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 UNC93AQ86WB7 457 aa22.15■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 IL21Q9HBE4 155 aa22.15■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.14■■□□□ 1.14
NELFE-208ENST00000481121 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 TRIM66O15016 1216 aa22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 ECI2O75521 394 aa22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 NOL4O94818 638 aa22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 CD58P19256 250 aa22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 FMO5P49326 533 aa22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 CYP4F8P98187 520 aa22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 ORC1Q13415 861 aa22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 ACOT1Q86TX2 421 aa22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 SMARCD2Q92925 531 aa22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.14■■□□□ 1.13
NELFE-208ENST00000481121 CFHP08603 1231 aa22.13■■□□□ 1.13
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