RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	FAM122A	Q96E09	287 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	GPR88	Q9GZN0	384 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PIEZO1	Q92508	2521 aa		15.81	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	KRBA1	A5PL33	1030 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PSMA7	O14818	248 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TACC1	O75410	805 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	VNN1	O95497	513 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	GDI1	P31150	447 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PFKP	Q01813	784 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ORC1	Q13415	861 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CAMK4	Q16566	473 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	NFIL3	Q16649	462 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ZACN	Q401N2	412 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	GAREM2	Q75VX8	874 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS33	Q8NF86	280 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC3	Q9BY71	257 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ABCB6	Q9NP58	842 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	F5	P12259	2224 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	IKBKB	O14920	756 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	MAPK13	O15264	365 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	NPR3	P17342	541 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PLA2G5	P39877	138 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2H	P62256	183 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN10	P78369	228 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PPP3CA	Q08209	521 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PCED1B	Q96HM7	432 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SHD	Q96IW2	340 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PKMYT1	Q99640	499 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		15.79	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ATP8B3	O60423	1300 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN5	O00501	218 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF263	O14978	683 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	STX10	O60499	249 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ABL1	P00519	1130 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PSMC3	P17980	439 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CD58	P19256	250 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	FCAR	P24071	287 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	AVPR1A	P37288	418 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	MXI1	P50539	228 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	NLRP12	P59046	1061 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	FAM171B	Q6P995	826 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	VIT	Q6UXI7	678 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	ADSSL1	Q8N142	457 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TAF4B	Q92750	862 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	SDCBP2	Q9H190	292 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	TASP1	Q9H6P5	420 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	NME7	Q9Y5B8	376 aa		15.78	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	NCAN	O14594	1321 aa		15.77	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PI15	O43692	258 aa		15.77	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CD72	P21854	359 aa		15.77	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CCNE1	P24864	410 aa		15.77	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	CLCN5	P51795	746 aa		15.77	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC63	Q05C16	580 aa		15.77	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	KRT39	Q6A163	491 aa		15.77	■□□□□ 0.12
SSR4-208	ENST00000471880	VSTM1	Q6UX27	236 aa		15.77	■□□□□ 0.12

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