RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.05□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 TFR2Q9UP52 801 aa8.05□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 COMMD10Q9Y6G5 202 aa8.05□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 TISP43B9A030 160 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 TRIM66O15016 1216 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 ABCB4P21439 1286 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 TAF6P49848 677 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 C1QTNF8P60827 252 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 MTA1Q13330 715 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 C1orf228Q6PIY5 440 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 TAS1R2Q8TE23 839 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 FAM149B1Q96BN6 582 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 UROC1Q96N76 676 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 PCYT2Q99447 389 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 A6NJR5 290 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 F8W8V4 182 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 CYP26A1O43174 497 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 PFKMP08237 780 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 CYP11B1P15538 503 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 TNFRSF8P28908 595 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 RFC2P35250 354 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 SLC1A1P43005 524 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 SOX10P56693 466 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 ITGA7Q13683 1181 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 SLC39A4Q6P5W5 647 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 SLFN11Q7Z7L1 901 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 ZNF653Q96CK0 615 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 TRPV6Q9H1D0 765 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 MTA2O94776 668 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 CALB1P05937 261 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 MCL1Q07820 350 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 C2orf54Q08AI8 447 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 CUL2Q13617 745 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 GRB14Q14449 540 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 NLRP14Q86W24 1093 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 TNS4Q8IZW8 715 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 STKLD1Q8NE28 680 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 PACSIN1Q9BY11 444 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 CARD9Q9H257 536 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 IKZF4Q9H2S9 585 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 ASB7Q9H672 318 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 SETD4Q9NVD3 440 aa8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 ALDH2P05091 517 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 CCND1P24385 295 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 PRKCZQ05513 592 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 KLC1Q07866 573 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 PDCLQ13371 301 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 NCOA4Q13772 614 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 FAM187BQ17R55 369 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 DEFB128Q7Z7B8 93 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 MGARPQ8TDB4 240 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 HELQQ8TDG4 1101 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 VCPIP1Q96JH7 1222 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 E7ENQ6 273 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 MYO1FO00160 1098 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 PFDN6O15212 129 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 THP07101 528 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 GJB1P08034 283 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 ATICP31939 592 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 ACOT2P49753 483 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 VEGFBP49765 207 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 PTENP60484 403 aa8.03□□□□□ -1.12
USP54-210ENST00000466048 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms