RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 MTF1Q14872 753 aa28.33■■■□□ 2.13
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PBRM1-218ENST00000458294 SDHAF4Q5VUM1 108 aa28.33■■■□□ 2.13
PBRM1-218ENST00000458294 KBTBD6Q86V97 674 aa28.33■■■□□ 2.13
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PBRM1-218ENST00000458294 SAAL1Q96ER3 474 aa28.33■■■□□ 2.13
PBRM1-218ENST00000458294 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
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PBRM1-218ENST00000458294 P2RY13Q9BPV8 354 aa28.33■■■□□ 2.13
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM206Q9H813 350 aa28.33■■■□□ 2.13
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PBRM1-218ENST00000458294 ITGA11Q9UKX5 1188 aa28.33■■■□□ 2.13
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PBRM1-218ENST00000458294 CYP2F1P24903 491 aa28.32■■■□□ 2.12
PBRM1-218ENST00000458294 GJA4P35212 333 aa28.32■■■□□ 2.12
PBRM1-218ENST00000458294 GALK1P51570 392 aa28.32■■■□□ 2.12
PBRM1-218ENST00000458294 CFAP221Q4G0U5 840 aa28.32■■■□□ 2.12
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PBRM1-218ENST00000458294 CXorf38Q8TB03 319 aa28.31■■■□□ 2.12
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PBRM1-218ENST00000458294 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
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PBRM1-218ENST00000458294 TBC1D7Q9P0N9 293 aa28.31■■■□□ 2.12
PBRM1-218ENST00000458294 GTF3C4Q9UKN8 822 aa28.31■■■□□ 2.12
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PBRM1-218ENST00000458294 CCDC6Q16204 474 aa28.3■■■□□ 2.12
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PBRM1-218ENST00000458294 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa28.3■■■□□ 2.12
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PBRM1-218ENST00000458294 ATP2A3Q93084 1043 aa28.3■■■□□ 2.12
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PBRM1-218ENST00000458294 STPG1Q5TH74 334 aa28.26■■■□□ 2.11
PBRM1-218ENST00000458294 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PBRM1-218ENST00000458294 FAM171BQ6P995 826 aa28.26■■■□□ 2.11
PBRM1-218ENST00000458294 C4orf50Q6ZRC1 276 aa28.26■■■□□ 2.11
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa28.26■■■□□ 2.11
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