RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441455.1

RPSAP20-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 20, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP20, Length 890 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP20-201ENST00000441455 TTC30AQ86WT1 665 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 CEP57Q86XR8 500 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 MSANTD4Q8NCY6 345 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 TPCN2Q8NHX9 752 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 DPF3Q92784 378 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 ABHD8Q96I13 439 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 TMEM209Q96SK2 561 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 YME1L1Q96TA2 773 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 RTP3Q9BQQ7 232 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 GPR62Q9BZJ7 368 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 SYNCQ9H7C4 482 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 CRTAC1Q9NQ79 661 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 ST7Q9NRC1 585 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 TJP2Q9UDY2 1190 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 COG5Q9UP83 839 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 NLRC5Q86WI3 1866 aa11.17□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 MYBPHLA2RUH7 354 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 CTAGE9A4FU28 777 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 CCDC85CA6NKD9 419 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 GOLGA8SH3BPF8 625 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 TULP2O00295 520 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 PIK3R2O00459 728 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 ENC1O14682 589 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 SYN3O14994 580 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 URI1O94763 535 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 FTCDO95954 541 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 ERBB2P04626 1255 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 SETSIPP0DME0 302 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 BCAT1P54687 386 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 TSPY1Q01534 308 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 PDE4CQ08493 712 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 BST2Q10589 180 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 PTPROQ16827 1216 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 TMEM240Q5SV17 173 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 DNAJC24Q6P3W2 148 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 FUKQ8N0W3 1084 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 OR10T2Q8NGX3 314 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 MYLPFQ96A32 169 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 PCED1BQ96HM7 432 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 VCPIP1Q96JH7 1222 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 B3GALT6Q96L58 329 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 CPXM1Q96SM3 734 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 ACBD6Q9BR61 282 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 B3GNT5Q9BYG0 378 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 GOLPH3Q9H4A6 298 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 UVRAGQ9P2Y5 699 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 STRIP2Q9ULQ0 834 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 SCINQ9Y6U3 715 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 MYH10P35580 1976 aa11.16□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 E5RJQ4 531 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 NCK2O43639 380 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 GJB6O95452 261 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 OR4Q2P0C623 313 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 LAG3P18627 525 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 HADHBP55084 474 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 MESDQ14696 234 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 TCEAL1Q15170 157 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 PKDCCQ504Y2 493 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 OR6B2Q6IFH4 312 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 ZNF280DQ6N043 979 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 KCNT2Q6UVM3 1135 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 DAAM2Q86T65 1068 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 FAM35AQ86V20 835 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 SYCE1Q8N0S2 351 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 ANKRD52Q8NB46 1076 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 C18orf8Q96DM3 657 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 BTBD6Q96KE9 485 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 ZNF558Q96NG5 402 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 SELENOOQ9BVL4 669 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 KRT82Q9NSB4 513 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 ANAPC7Q9UJX3 599 aa11.15□□□□□ -0.62
RPSAP20-201ENST00000441455 PTPRDP23468 1912 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms