RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		19.04	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	HR	O43593	1189 aa		19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	KLRC4	O43908	158 aa		19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	SLFN14	P0C7P3	912 aa		19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	CCNE1	P24864	410 aa		19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	CDC25C	P30307	473 aa		19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	AFM	P43652	599 aa		19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	MYL7	Q01449	175 aa		19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	GAS6	Q14393	721 aa		19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	DPH6	Q7L8W6	267 aa		19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	GIPC2	Q8TF65	315 aa		19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	ABCB6	Q9NP58	842 aa		19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	OBP2A	Q9NY56	170 aa		19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		19.03	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	PTPRD	P23468	1912 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	CLIC2	O15247	247 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	CHAD	O15335	359 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	TNNC2	P02585	160 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	CNR2	P34972	360 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	LHX1	P48742	406 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	MYO1E	Q12965	1108 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	CSRP2	Q16527	193 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	PPM1J	Q5JR12	505 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR158	Q5T848	1215 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	MSANTD3	Q96H12	275 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	TASP1	Q9H6P5	420 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	HPSE	Q9Y251	543 aa		19.02	■□□□□ 0.64
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	F11	P03951	625 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	FNTB	P49356	437 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP4F8	P98187	520 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP24A1	Q07973	514 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC32	Q14392	662 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMD6	Q15008	389 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM171B	Q6P995	826 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	YAF2	Q8IY57	180 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	RDH13	Q8NBN7	331 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	HPDL	Q96IR7	371 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		19.01	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	HCRT	O43612	131 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	PRAMEF12	O95522	483 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CSH1	P0DML2	217 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CSH2	P0DML3	217 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CMA1	P23946	247 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	PCSK1	P29120	753 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR15	P49685	360 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	DMWD	Q09019	674 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	ST3GAL2	Q16842	350 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC142	Q17RM4	750 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	LONP2	Q86WA8	852 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	PAGE5	Q96GU1	130 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CGRRF1	Q99675	332 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		19	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1B0GVL5	298 aa		18.99	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		18.99	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	18.99	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	18.99	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	PFKFB1	P16118	471 aa		18.99	■□□□□ 0.63
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP2F1	P24903	491 aa		18.99	■□□□□ 0.63

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