RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 SMYD5Q6GMV2 418 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 LCLAT1Q6UWP7 414 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 MFSD7Q6UXD7 560 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 RAPGEF5Q92565 580 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ZFP42Q96MM3 310 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 SLITRK1Q96PX8 696 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa24.47■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 OPA1O60313 960 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 AOC2O75106 756 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ELNP15502 786 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 TTMPQ5BVD1 217 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO47Q5MNV8 452 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 NIPA2Q8N8Q9 360 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 MAIP1Q8WWC4 291 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC114Q96M63 670 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ZWILCHQ9H900 591 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 SPC25Q9HBM1 224 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 MEIS3P2A8K0S8 358 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 E5RJQ4 531 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 PFKMP08237 780 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 KCNT1Q5JUK3 1230 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF618Q5T7W0 954 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 TTC39CQ8N584 583 aa24.46■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 LRRD1A4D1F6 860 aa24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA6CA6NDK9 693 aa24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 M0QZ92 97 aa24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 SEPT4O43236 478 aa24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 KPNA6O60684 536 aa24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 LRCH4O75427 683 aa24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 PDGFRBP09619 1106 aa24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA6DP0CG33 693 aa24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 DRG2P55039 364 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 ODF2Q5BJF6 829 aa24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 KCTD16Q68DU8 428 aa24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 RCOR2Q8IZ40 523 aa24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 RUNDC3BQ96NL0 473 aa24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 WDR35Q9P2L0 1181 aa24.45■■□□□ 1.51
FAAP20-209ENST00000428120 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 PIRO00625 290 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 TTC30AQ86WT1 665 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA1257Q9ULG3 409 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.45■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 A8MXQ7 604 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 GRAP2O75791 330 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 CD4P01730 458 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 IL1R2P27930 398 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 GABRB2P47870 512 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC38Q5VT99 294 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 MCRS1Q96EZ8 462 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 CACNG4Q9UBN1 327 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 KPNA7A9QM74 516 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 RPS6KA5O75582 802 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 KCNE1P15382 129 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 LMAN1P49257 510 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 CDR1P51861 262 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 DMTNQ08495 405 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 CEP85LQ5SZL2 805 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 OR6B2Q6IFH4 312 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 PMF1Q6P1K2 205 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 ASIC3Q9UHC3 531 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 PCSK1NQ9UHG2 260 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.44■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 CHRNA1P02708 482 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 ASGR1P07306 291 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 FGFR1P11362 822 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 LMO2P25791 158 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 VPS41P49754 854 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 XKR4Q5GH76 650 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 EXOC4Q96A65 974 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 HAUS1Q96CS2 278 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 TRPV2Q9Y5S1 764 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA8KD6RF30 607 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 ADAMTS4O75173 837 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 CETN2P41208 172 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 GSCP56915 257 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 SH2D3CQ8N5H7 860 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 SLCO2A1Q92959 643 aa24.43■■□□□ 1.5
FAAP20-209ENST00000428120 PTGESO14684 152 aa24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms