RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP2A1O14983 1001 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 MARK3P27448 753 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFSF9P41273 254 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 NAMPTP43490 491 aa19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP19.64■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 34.6
SH3BP1-202ENST00000417536 TTLL13PA6NNM8 815 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 EDF1O60869 148 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 CDKN2BP42772 138 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF132P52740 706 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 YARSP54577 528 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 SMTNL2Q2TAL5 461 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 GPAT2Q6NUI2 795 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB33Q86T24 672 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 COPS5Q92905 334 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 MIEF2Q96C03 454 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 RRAGCQ9HB90 399 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF302Q9NR11 478 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ARIH2O95376 493 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT4P19013 534 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF449Q6P9G9 518 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 LVRNQ6Q4G3 990 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC7A3Q8WY07 619 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC10A4Q96EP9 437 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 CDHR1Q96JP9 859 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 MTMR12Q9C0I1 747 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 SENP1Q9P0U3 644 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 PIGRP01833 764 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 OATP04181 439 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 FGFR1P11362 822 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 SSTR1P30872 391 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 GPX6P59796 221 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 MYL6P60660 151 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 STXBP2Q15833 593 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 HIF1AQ16665 826 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC142Q17RM4 750 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 GNPTABQ3T906 1256 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC38Q5VT99 294 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ZWILCHQ9H900 591 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDH9Q9HC56 1237 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNG1Q9UIX4 513 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 SUFUQ9UMX1 484 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 SHOC2Q9UQ13 582 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 TYROBPO43914 113 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGAVP06756 1048 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 TFDP1Q14186 410 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD22Q5VYY1 191 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM35BQ8NCS4 154 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 TCHPQ9BT92 498 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRA2Q96PE1 1338 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR91A4D1P6 747 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ASS1P00966 412 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 WEE2P0C1S8 567 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ARL2P36404 184 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 GDF10P55107 478 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNT1Q5JUK3 1230 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 RIOX2Q8IUF8 465 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF570Q96NI8 536 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 CISHQ9NSE2 258 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ALDH3A1P30838 453 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 MSS51Q4VC12 460 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 RGS9BPQ6ZS82 235 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 WDTC1Q8N5D0 677 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 UBR7Q8N806 425 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNV2Q8TDN2 545 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC24A2Q9UI40 661 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 CLUHO75153 1309 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC18A1P54219 525 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 FNBP1LQ5T0N5 605 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 ACTL9Q8TC94 416 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 PYROXD1Q8WU10 500 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 C10orf82Q8WW14 230 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 TFAP2BQ92481 460 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 LRMDAQ9H2I8 198 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 PDGFCQ9NRA1 345 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 DCTN3O75935 186 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 CBX6O95503 412 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 PPIL2Q13356 520 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP1-202ENST00000417536 OTOAQ7RTW8 1153 aa19.6■□□□□ 0.73
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