RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC140Q96MF4 163 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 FRMD6Q96NE9 622 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM74Q96NL1 305 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 PNKPQ96T60 521 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASCL2Q99929 193 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNMB3Q9NPA1 279 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP-0.5□□□□□ -2.49
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RNU6-172P-201ENST00000411000 APEX2Q9UBZ4 518 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHA12Q9UN75 941 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 NR2E3Q9Y5X4 410 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZMYM3Q14202 1370 aa-0.5□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
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RNU6-172P-201ENST00000411000 F6X3S4 739 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 P2RY10O00398 339 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 WNT10BO00744 389 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 FOXP2O15409 715 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRSS2P07478 247 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPTP24298 496 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIMP3P35625 211 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF165P49910 485 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 ST13P50502 369 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 ROM1Q03395 351 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 RUNX1T1Q06455 604 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC39A14Q15043 492 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 ST3GAL2Q16842 350 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF793Q6ZN11 406 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 EP400NLQ6ZTU2 488 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLNKQ7Z7G1 428 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAGSQ8N159 534 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 LYPD1Q8N2G4 141 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRR26Q8N8Z3 221 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 POC1AQ8NBT0 407 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 FKBP10Q96AY3 582 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 LGALS12Q96DT0 336 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
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RNU6-172P-201ENST00000411000 DCLK3Q9C098 648 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 DKK3Q9UBP4 350 aa-0.51□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP-0.51□□□□□ -2.49
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RNU6-172P-201ENST00000411000 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa-0.52□□□□□ -2.49
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RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa-0.52□□□□□ -2.49
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RNU6-172P-201ENST00000411000 EDN1P05305 212 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
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RNU6-172P-201ENST00000411000 NR1D1P20393 614 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 GUCY2CP25092 1073 aa-0.52□□□□□ -2.49
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RNU6-172P-201ENST00000411000 PWP1Q13610 501 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa-0.52□□□□□ -2.49
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa-0.52□□□□□ -2.49
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ATRIPQ8WXE1 791 aa-0.52□□□□□ -2.49
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SNX18Q96RF0 628 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 F2RL3Q96RI0 385 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 CABLES2Q9BTV7 478 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 FSD1LQ9BXM9 530 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 FZD3Q9NPG1 666 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNQ5Q9NR82 932 aa-0.52□□□□□ -2.49
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAN1B1Q9UKM7 699 aa-0.52□□□□□ -2.49
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