RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	ITGB8	P26012	769 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	PDE4C	Q08493	712 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	STIL	Q15468	1287 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	ELF2	Q15723	593 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	KRT35	Q92764	455 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	UST	Q9Y2C2	406 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	LAMA3	Q16787	3333 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	CEP104	O60308	925 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	TADA3	O75528	432 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	CXCL10	P02778	98 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	PBX3	P40426	434 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	PAFAH1B1	P43034	410 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	LHX1	P48742	406 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	MARCKSL1	P49006	195 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	BCAR1	P56945	870 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	UROC1	Q96N76	676 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	INPPL1	O15357	1258 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	KRT3	P12035	628 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	DSC1	Q08554	894 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	XYLT1	Q86Y38	959 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	EMC1	Q8N766	993 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	C3orf20	Q8ND61	904 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	ALG3	Q92685	438 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	CASD1	Q96PB1	797 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	MED10	Q9BTT4	135 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	GRAP2	O75791	330 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	CSF2RA	P15509	400 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	IKBKE	Q14164	716 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	LLGL1	Q15334	1064 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	PKDCC	Q504Y2	493 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	METTL23	Q86XA0	190 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	FUK	Q8N0W3	1084 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	SYT15	Q9BQS2	421 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	MIS12	Q9H081	205 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	RAG1	P15918	1043 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	GJC1	P36383	396 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	C2orf54	Q08AI8	447 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	GOLGA1	Q92805	767 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300		F8VP50	259 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	TADA2A	O75478	443 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	BEST1	O76090	585 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	RABGGTB	P53611	331 aa		11.87	□□□□□ -0.51
RAD9B-204	ENST00000409300	BCAT1	P54687	386 aa		11.87	□□□□□ -0.51

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