RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 ADAM9Q13443 819 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 E2F7Q96AV8 911 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 RSPRY1Q96DX4 576 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 GSDMAQ96QA5 445 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 FOXQ1Q9C009 403 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 TASP1Q9H6P5 420 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 MIA3Q5JRA6 1907 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 IKBKBO14920 756 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 KRT13P13646 458 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 GDI1P31150 447 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 PRCPP42785 496 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 MAGEA11P43364 429 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 NLRP12P59046 1061 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP27A1Q02318 531 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 PRKCQQ04759 706 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 SV2AQ7L0J3 742 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 MFSD6LQ8IWD5 586 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 SMARCE1Q969G3 411 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 PCED1BQ96HM7 432 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 GREB1Q4ZG55 1949 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa21.61■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 A8MXQ7 604 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 NOL4O94818 638 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 F11P03951 625 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM49P0CI25 452 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM49CP0CI26 452 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 BDNFP23560 247 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 RAP1GAPP47736 663 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 CDH8P55286 799 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 EDRF1Q3B7T1 1238 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM150AQ86TG1 271 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 DNASE1L2Q92874 299 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 IRF7Q92985 503 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 DPEP3Q9H4B8 488 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 HEBP1Q9NRV9 189 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.6■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 KANSL1LA0AUZ9 987 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 H0Y858 1186 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 DPYSL4O14531 572 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 KINO60870 393 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 COL4A2P08572 1712 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 PIK3CAP42336 1068 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 GCLMP48507 274 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 VSTM1Q6UX27 236 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 TPRG1Q6ZUI0 275 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 YAF2Q8IY57 180 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 DTWD2Q8NBA8 298 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 PJA1Q8NG27 643 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 SPATA20Q8TB22 786 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC46A2Q9BY10 475 aa21.59■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF263O14978 683 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 PRAMEF12O95522 483 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 HLA-DRAP01903 254 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 DCNP07585 359 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 CD72P21854 359 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 GRIK1P39086 918 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP3CAQ08209 521 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 TAF4BQ92750 862 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 MYRFLQ96LU7 910 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 SDCBP2Q9H190 292 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
ANKRD39-201ENST00000393537 CETN3O15182 167 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRN2O75325 713 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 P4HA1P13674 534 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ANXA13P27216 316 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 WEE1P30291 646 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 ENPEPQ07075 957 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 UBXN2BQ14CS0 331 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.57■■□□□ 1.04
ANKRD39-201ENST00000393537 TXNDC8Q6A555 127 aa21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms