RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376854.5

C9orf40-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf40, Length 2,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40-201ENST00000376854 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
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C9orf40-201ENST00000376854 TLDC1Q6P9B6 456 aa26.59■■□□□ 1.85
C9orf40-201ENST00000376854 PPIL6Q8IXY8 311 aa26.59■■□□□ 1.85
C9orf40-201ENST00000376854 ERP27Q96DN0 273 aa26.59■■□□□ 1.85
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C9orf40-201ENST00000376854 KCNT1Q5JUK3 1230 aa26.58■■□□□ 1.85
C9orf40-201ENST00000376854 TREML2Q5T2D2 321 aa26.58■■□□□ 1.85
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C9orf40-201ENST00000376854 FAM160B1Q5W0V3 765 aa26.58■■□□□ 1.85
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C9orf40-201ENST00000376854 PYROXD1Q8WU10 500 aa26.58■■□□□ 1.85
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C9orf40-201ENST00000376854 ANP32DO95626 131 aa26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 CCND1P24385 295 aa26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 IL1R2P27930 398 aa26.57■■□□□ 1.84
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C9orf40-201ENST00000376854 LRRC37BQ96QE4 947 aa26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 CHKBQ9Y259 395 aa26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 EFR3BQ9Y2G0 817 aa26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 LRCH4O75427 683 aa26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 KRT7P08729 469 aa26.57■■□□□ 1.84
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C9orf40-201ENST00000376854 KRT4P19013 534 aa26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 PHBP35232 272 aa26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 TFDP1Q14186 410 aa26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 FNBP1LQ5T0N5 605 aa26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 CHST13Q8NET6 341 aa26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 JOSD2Q8TAC2 188 aa26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 TJP2Q9UDY2 1190 aa26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa26.57■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 SIGLEC16A6NMB1 481 aa26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 PRKCBP05771 671 aa26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 CD19P15391 556 aa26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 SSTR1P30872 391 aa26.56■■□□□ 1.84
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C9orf40-201ENST00000376854 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 SURF1Q15526 300 aa26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 ATP11CQ8NB49 1132 aa26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 TTC13Q8NBP0 860 aa26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 HADHQ16836 314 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 MSS51Q4VC12 460 aa26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 BBS12Q6ZW61 710 aa26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 RHPN2Q8IUC4 686 aa26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 RSAD2Q8WXG1 361 aa26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 XYLT2Q9H1B5 865 aa26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 ATP5HO75947 161 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 HOXC6P09630 235 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 ATP11AP98196 1134 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa26.55■■□□□ 1.84
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C9orf40-201ENST00000376854 LVRNQ6Q4G3 990 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 NAT8LQ8N9F0 302 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 RNF149Q8NC42 400 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 NSMCE1Q8WV22 266 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 PHACTR1Q9C0D0 580 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 CYTH4Q9UIA0 394 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 C15orf41Q9Y2V0 281 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 DCTN3O75935 186 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 KDELR1P24390 212 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 ALDH3A1P30838 453 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
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C9orf40-201ENST00000376854 IER5Q5VY09 327 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 BTBD7Q9P203 1132 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 FETUBQ9UGM5 382 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 POLIQ9UNA4 740 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 ABLIM1O14639 778 aa26.54■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 RPL22P35268 128 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa26.54■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa26.54■■□□□ 1.84
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