RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 GTF3C4Q9UKN8 822 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRK-201ENST00000368202 STRIP2Q9ULQ0 834 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRK-201ENST00000368202 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRK-201ENST00000368202 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRK-201ENST00000368202 NME7Q9Y5B8 376 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRK-201ENST00000368202 GBF1Q92538 1859 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRK-201ENST00000368202 VWA8A3KMH1 1905 aa12.9□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 USP27XA6NNY8 438 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 PJA2O43164 708 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 KIF5CO60282 957 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 CAPN15O75808 1086 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 SOD2P04179 222 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 CFHP08603 1231 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 CTNNB1P35222 781 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 GLUD2P49448 558 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 ARPP19P56211 112 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 CREMQ03060 361 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 SHHQ15465 462 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 PSMD5Q16401 504 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 C9orf50Q5SZB4 431 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF662Q6ZS27 426 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 PALB2Q86YC2 1186 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 RHOT2Q8IXI1 618 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 ANKRD52Q8NB46 1076 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 SMARCD1Q96GM5 515 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 VCPIP1Q96JH7 1222 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 ALS2CR12Q96Q35 445 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 C11orf70Q9BRQ4 267 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 THAP2Q9H0W7 228 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 CRTAC1Q9NQ79 661 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 SCINQ9Y6U3 715 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 MACROD2A1Z1Q3 448 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 MYBPHLA2RUH7 354 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 CLDN5O00501 218 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 C2CD2LO14523 706 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 LPXNO60711 386 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 AP1G2O75843 785 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 FGF18O76093 207 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 ACADSBP45954 432 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 RABGGTBP53611 331 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 PLCB3Q01970 1234 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 SMARCB1Q12824 385 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 SLC39A12Q504Y0 691 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 RASIP1Q5U651 963 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 KIAA0319Q5VV43 1072 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 FAM35AQ86V20 835 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 MCOLN2Q8IZK6 566 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 MYLPFQ96A32 169 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 C18orf8Q96DM3 657 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 PCED1BQ96HM7 432 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 B3GALT6Q96L58 329 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 LPIN3Q9BQK8 851 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 ZSWIM1Q9BR11 485 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 PACSIN1Q9BY11 444 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 DUSP16Q9BY84 665 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 B3GNT5Q9BYG0 378 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 KRT82Q9NSB4 513 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 WDR35Q9P2L0 1181 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 NENFQ9UMX5 172 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 BTNL10A8MVZ5 291 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 TUBB4AP04350 444 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 OR4Q2P0C623 313 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 NPR3P17342 541 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 GPD2P43304 727 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 RGS19P49795 217 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 PDE4CQ08493 712 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 RTP2Q5QGT7 225 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 FAM171BQ6P995 826 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 MON1BQ7L1V2 547 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 TAS1R1Q7RTX1 841 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 TTC30AQ86WT1 665 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 DNAAF5Q86Y56 855 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRK-201ENST00000368202 VPS52Q8N1B4 723 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms