RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 CISHQ9NSE2 258 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 SETD4Q9NVD3 440 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 C22orf31O95567 290 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 BRD2P25440 801 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 RAP1GAPP47736 663 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 RIPK1Q13546 671 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM35BQ8NCS4 154 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 GDAP1Q8TB36 358 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 MAML3Q96JK9 1138 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM167AQ96KS9 214 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 AGAP1Q9UPQ3 857 aa19.75■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 SUN1O94901 812 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 EFNA5P52803 228 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 OASLQ15646 514 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 ATF7IP2Q5U623 682 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP4F22Q6NT55 531 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGEB18Q96M61 343 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 CFAP57Q96MR6 1250 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 NIF3L1Q9GZT8 377 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 IFT122Q9HBG6 1241 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 SAYSD1Q9NPB0 183 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 FLRT1Q9NZU1 646 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 H3BRB1 525 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR25O00155 361 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 GCAP28676 217 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 ARSEP51690 589 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 TAP1Q03518 808 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 KIZQ2M2Z5 673 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 DCUN1D2Q6PH85 259 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP57Q86XR8 500 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 NIPA2Q8N8Q9 360 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKAG3Q9UGI9 489 aa19.74■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 UBOX5O94941 541 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 ETS1P14921 441 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 STX2P32856 288 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 DUOXA2Q1HG44 320 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 TFDP3Q5H9I0 405 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 C16orf70Q9BSU1 422 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 KATNBL1Q9H079 304 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 NOD2Q9HC29 1040 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGC3Q9UN70 934 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 HBP1O60381 514 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 CYP2B6P20813 491 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 CDKN2BP42772 138 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 VCPP55072 806 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR72Q3MJ13 1102 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 SPATA21Q7Z572 469 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 NLRP7Q8WX94 980 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 TFAP2BQ92481 460 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC25Q96NG3 672 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC37A2A6NM11 1700 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 RASA4BC9J798 803 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 ABLIM1O14639 778 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 OGTO15294 1046 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 RASA4O43374 803 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 CDH8P55286 799 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 GPS1Q13098 491 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 MORF4L2Q15014 288 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 TDRPQ86YL5 185 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 POLIQ9UNA4 740 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa19.73■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 MBTD1Q05BQ5 628 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 ZIC5Q96T25 663 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 CXorf56Q9H5V9 222 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 ITGAVP06756 1048 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 NCALDP61601 193 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 TMED2Q15363 201 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 CGB2Q6NT52 195 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP1-201ENST00000357436 DPH6Q7L8W6 267 aa19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms