RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 TRIM49D1C9J1S8 452 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 STRNO43815 780 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 C10orf88Q9H8K7 445 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 VHLP40337 213 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 HARS2P49590 506 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 DNAJC3Q13217 504 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 FAM83EQ2M2I3 478 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 SV2CQ496J9 727 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 C10orf120Q5SQS8 335 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 OOSP2Q86WS3 158 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 OPTNQ96CV9 577 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 A0A0G2JLW4 131 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 RSPH10B2B2RC85 870 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 RPS6KA5O75582 802 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 RSPH10BP0C881 870 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 MFSD4BQ5TF39 518 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 MDM1Q8TC05 714 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 DEPDC7Q96QD5 511 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 PI4K2AQ9BTU6 479 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 SLC40A1Q9NP59 571 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 KRT84Q9NSB2 600 aa16.69■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 MYMKA6NI61 221 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 DARSP14868 501 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 CCZ1BP86790 482 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 COG2Q14746 738 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 ATF7IP2Q5U623 682 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 VN1R5Q7Z5H4 357 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 SEPT1Q8WYJ6 367 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 KCTD10Q9H3F6 313 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 ALG6Q9Y672 507 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 PMPCBO75439 489 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 ZNF23P17027 643 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 OR1G1P47890 313 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 KLK7P49862 253 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 NCKAP1LP55160 1127 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 IER5Q5VY09 327 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 ANKRD49Q8WVL7 239 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 BHMTQ93088 406 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 ERP44Q9BS26 406 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 DIABLOQ9NR28 239 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 ITIH6Q6UXX5 1313 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 CENPCQ03188 943 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 CNTN1Q12860 1018 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 STK4Q13043 487 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 SLC29A2Q14542 456 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 KCNB2Q92953 911 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 SERPINB5P36952 375 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 FAXCQ5TGI0 409 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 FAM111AQ96PZ2 611 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 RNPEPQ9H4A4 650 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 SUPT7LO94864 414 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 RHOBTB3O94955 611 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 IL18RAPO95256 599 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 DSG1Q02413 1049 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 C12orf60Q5U649 245 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 CACHD1Q5VU97 1274 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 CXorf56Q9H5V9 222 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 CDHR2Q9BYE9 1310 aa16.68■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 STX7O15400 261 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 ALDH1A2O94788 518 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 TMEM253P0C7T8 217 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 GALNTL6Q49A17 601 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 SDE2Q6IQ49 451 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 TRIM48Q8IWZ4 208 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 NDEL1Q9GZM8 345 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 KCNF1Q9H3M0 494 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 SLC38A7Q9NVC3 462 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 PCSK1P29120 753 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 HSPA13P48723 471 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 EFHC1Q5JVL4 640 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 ZNF614Q8N883 585 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 DDHD1Q8NEL9 900 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 GLMNQ92990 594 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 PHF20Q9BVI0 1012 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 KATNAL1Q9BW62 490 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 SMAPO00193 183 aa16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
RXRA-201ENST00000356384 PRKCEQ02156 737 aa16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms