RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 AGAP11Q8TF27 550 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 CENPTQ96BT3 561 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 AKT3Q9Y243 479 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 PGM3O95394 542 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 PHKA2P46019 1235 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 NCALDP61601 193 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 DPYDQ12882 1025 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 DDR2Q16832 855 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNV1Q6PIU1 500 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC35G2Q8TBE7 412 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATA16Q9BXB7 569 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM165Q9HC07 324 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 IRGMA1A4Y4 181 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 FOXN1O15353 648 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB2AP61019 212 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 COX10Q12887 443 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 DPP10Q8N608 796 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF507Q8TCN5 953 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 LGR6Q9HBX8 967 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 CHD1O14646 1710 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 UNC13BO14795 1591 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNA2P16389 499 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ABI1Q8IZP0 508 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 FNIP1Q8TF40 1166 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 AIM2O14862 343 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 AP5Z1O43299 807 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 TNFRSF8P28908 595 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ADD2P35612 726 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 IFNGR2P38484 337 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 RPS6P62753 249 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 HEY2Q9UBP5 337 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ING4Q9UNL4 249 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 TMIEQ8NEW7 156 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 STK39Q9UEW8 545 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 SNAP91O60641 907 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 OGNP20774 298 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 RPS6KA3P51812 740 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM63BQ5T3F8 832 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 OR6B2Q6IFH4 312 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 HEATR4Q86WZ0 1026 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 NEU2Q9Y3R4 380 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 MYO3BQ8WXR4 1341 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ALAS1P13196 640 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 NNMTP40261 264 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC153Q494R4 210 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 TUBA3EQ6PEY2 450 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB33Q86T24 672 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 MKNK1Q9BUB5 465 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 SERPINB13Q9UIV8 391 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 TEX28O15482 410 aa11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 USP11P51784 963 aa11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 EFNA5P52803 228 aa11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 TUBA1BP68363 451 aa11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 PDK1Q15118 436 aa11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 NEK5Q6P3R8 708 aa11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 TUBA1AQ71U36 451 aa11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 PPIL6Q8IXY8 311 aa11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP10BO94823 1461 aa11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 HNMTP50135 292 aa11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF135Q8IUD6 432 aa11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 DENND6AQ8IWF6 608 aa11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 UBP1Q9NZI7 540 aa11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa11.02□□□□□ -0.64
SH3BP2-201ENST00000356331 XDHP47989 1333 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CITO14578 2027 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 CPA2P48052 419 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MZT2AQ6P582 158 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF560Q96MR9 790 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PLEKHG3A1L390 1219 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 ACTR2P61160 394 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 MED15Q96RN5 788 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 COPZ1P61923 177 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 AGAP9Q5VTM2 703 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM180AQ6UWF9 173 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 SIX5Q8N196 739 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 AMER2Q8N7J2 671 aa11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms