RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333188.9

COPB2-201, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPB2, Length 3,360 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-201ENST00000333188 CPT1AP50416 773 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 PMS2P54278 862 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 DCAF6Q58WW2 860 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 WSCD1Q658N2 575 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 SLC27A1Q6PCB7 646 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 MON1BQ7L1V2 547 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 SLFN11Q7Z7L1 901 aa9.5□□□□□ -0.89
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COPB2-201ENST00000333188 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
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COPB2-201ENST00000333188 CHKAP35790 457 aa9.5□□□□□ -0.89
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COPB2-201ENST00000333188 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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COPB2-201ENST00000333188 PMF1Q6P1K2 205 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 CASC4Q6P4E1 433 aa9.5□□□□□ -0.89
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COPB2-201ENST00000333188 SCN4BQ8IWT1 228 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 WDTC1Q8N5D0 677 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.5□□□□□ -0.89
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COPB2-201ENST00000333188 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 SIK2Q9H0K1 926 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 LRRC4Q9HBW1 653 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 SLC15A5A6NIM6 579 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 GOLGA8RI6L899 631 aa9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 CAND2O75155 1236 aa9.5□□□□□ -0.89
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COPB2-201ENST00000333188 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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COPB2-201ENST00000333188 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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COPB2-201ENST00000333188 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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COPB2-201ENST00000333188 CYB561D2O14569 222 aa9.49□□□□□ -0.89
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COPB2-201ENST00000333188 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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COPB2-201ENST00000333188 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 C11orf63Q6NUN7 778 aa9.49□□□□□ -0.89
COPB2-201ENST00000333188 HOOK3Q86VS8 718 aa9.49□□□□□ -0.89
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