RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 PTGISQ16647 500 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 HACE1Q8IYU2 909 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 HERPUD2Q9BSE4 406 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 DPH5Q9H2P9 285 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA6BA6NDN3 693 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 PODXLO00592 558 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 PFKMP08237 780 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 RALAP11233 206 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 TCF4P15884 667 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 PSMA2P25787 234 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 LRPAP1P30533 357 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 LLGL1Q15334 1064 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 NEUROG2Q9H2A3 272 aa28.29■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 GPR182O15218 404 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 SETSIPP0DME0 302 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 DRG2P55039 364 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 PKDCCQ504Y2 493 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 LIMS2Q7Z4I7 341 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 RCOR2Q8IZ40 523 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 FAM71BQ8TC56 605 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 OSBPL8Q9BZF1 889 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 THPOP40225 353 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 CETN2P41208 172 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 ALS2CLQ60I27 953 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP17Q68EM7 881 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC105Q8IYK2 499 aa28.28■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 A8MXQ7 604 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 KRT1P04264 644 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 SLCO2A1Q92959 643 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM31Q9BZY9 425 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
HOXD8-201ENST00000313173 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 CABYRO75952 493 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 TTC30AQ86WT1 665 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 APPL2Q8NEU8 664 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 C1orf54Q8WWF1 131 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 ZFP42Q96MM3 310 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 FAM49BQ9NUQ9 324 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 AGPSO00116 658 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 FGFR1P11362 822 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 GGCXP38435 758 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 POLNQ7Z5Q5 900 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 RNF180Q86T96 592 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 CRYBG2Q8N1P7 616 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 PXYLP1Q8TE99 480 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 ZBTB9Q96C00 473 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 SLITRK1Q96PX8 696 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 DCLK3Q9C098 648 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 DNAI2Q9GZS0 605 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 SNX25Q9H3E2 840 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 DPEP3Q9H4B8 488 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 HOMER3Q9NSC5 361 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 SLC38A7Q9NVC3 462 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 HESX1Q9UBX0 185 aa28.26■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 E5RJQ4 531 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 HSF2BPO75031 334 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 ECEL1O95672 775 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 SYF2O95926 243 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 LILRA4P59901 499 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 HEMGNQ9BXL5 484 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 KLHL11Q9NVR0 708 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 CEP350Q5VT06 3117 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 MEIS3P2A8K0S8 358 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 GBP1P32455 592 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 COPS2P61201 443 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 PTK7Q13308 1070 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 ITGA7Q13683 1181 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGEF6Q15052 776 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 TOP6BLQ8N6T0 577 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 EMC1Q8N766 993 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 CHST7Q9NS84 486 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 HUS1O60921 280 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 LRCH4O75427 683 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 PTPN7P35236 360 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 MLH1P40692 756 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 KCNJ1P48048 391 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 ACAP1Q15027 740 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC45Q96CN5 670 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 SLC4A5Q9BY07 1137 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 FAM193AP78312 1265 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms