RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 A0A1B0GUA9 196 aa25.24■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 STAU1O95793 577 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 HMGCRP04035 888 aa25.24■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 RBP5P82980 135 aa25.24■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 INCA1Q0VD86 236 aa25.24■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 RELL1Q8IUW5 271 aa25.24■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa25.24■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa25.23■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 GABRB2P47870 512 aa25.23■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 OASLQ15646 514 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 CNGA2Q16280 664 aa25.23■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa25.23■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 EMC1Q8N766 993 aa25.23■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 HAUS1Q96CS2 278 aa25.23■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 GRM5P41594 1212 aa25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 ARSEP51690 589 aa25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 DGKDQ16760 1214 aa25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 SMTNL2Q2TAL5 461 aa25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 TTC39CQ8N584 583 aa25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 GLIS1Q8NBF1 620 aa25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 GGA2Q9UJY4 613 aa25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 EFR3BQ9Y2G0 817 aa25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 ITGAVP06756 1048 aa25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 IL1R2P27930 398 aa25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 ATP5DP30049 168 aa25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 MCRS1Q96EZ8 462 aa25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 KIF12Q96FN5 646 aa25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 RASSF4Q9H2L5 321 aa25.22■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 KIAA0754O94854 1291 aa25.21■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 GPD2P43304 727 aa25.21■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 MAGEA9P43362 315 aa25.21■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 NDST1P52848 882 aa25.21■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 ACVR2BQ13705 512 aa25.21■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 TINF2Q9BSI4 451 aa25.21■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa25.21■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 KAT6AQ92794 2004 aa25.21■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 C5orf60A6NFR6 353 aa25.2■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 TCEA3O75764 348 aa25.2■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC38Q502W7 563 aa25.2■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.63
TRIM54-201ENST00000296098 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa25.2■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 GPS1Q13098 491 aa25.2■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 KCNT1Q5JUK3 1230 aa25.2■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 DPH6Q7L8W6 267 aa25.2■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 SLC35B2Q8TB61 432 aa25.2■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 CHMP6Q96FZ7 201 aa25.2■■□□□ 1.62
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TRIM54-201ENST00000296098 PCDH9Q9HC56 1237 aa25.2■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 NDC80O14777 642 aa25.19■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 NPTXRO95502 500 aa25.19■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 ETS1P14921 441 aa25.19■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 PLCB3Q01970 1234 aa25.19■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 ACAP1Q15027 740 aa25.19■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 QPCTQ16769 361 aa25.19■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 KIZQ2M2Z5 673 aa25.19■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 PLEKHH3Q7Z736 793 aa25.19■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 EXOC3L1Q86VI1 746 aa25.19■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
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TRIM54-201ENST00000296098 SGK1O00141 431 aa25.19■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 KDELR1P24390 212 aa25.19■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 DYNLT1P63172 113 aa25.19■■□□□ 1.62
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TRIM54-201ENST00000296098 UBA3Q8TBC4 463 aa25.19■■□□□ 1.62
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TRIM54-201ENST00000296098 ZNF236Q9UL36 1845 aa25.18■■□□□ 1.62
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TRIM54-201ENST00000296098 RRN3P2A6NIE6 340 aa25.18■■□□□ 1.62
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TRIM54-201ENST00000296098 MAGEA4P43358 317 aa25.18■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 MORF4L2Q15014 288 aa25.18■■□□□ 1.62
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TRIM54-201ENST00000296098 LCLAT1Q6UWP7 414 aa25.18■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TRIM54-201ENST00000296098 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa25.18■■□□□ 1.62
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