RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295927.3

PTX3-201, Transcript of pentraxin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX3, Length 1,940 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3-201ENST00000295927 KRT3P12035 628 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 RWDD2BP57060 319 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 OGDHQ02218 1023 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 TIGD5Q53EQ6 642 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 CLLU1OSQ5K130 101 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 TMEM86AQ8N2M4 240 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 SLC35F5Q8WV83 523 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 MCRS1Q96EZ8 462 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 UROC1Q96N76 676 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 AP1M1Q9BXS5 423 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 USTQ9Y2C2 406 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 TET1Q8NFU7 2136 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 TANC1Q9C0D5 1861 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 ATP2C2O75185 946 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 B3GAT3O94766 335 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 PYGMP11217 842 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 ADORA2BP29275 332 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 RGS7P49802 495 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 PDE4CQ08493 712 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 PMF1Q6P1K2 205 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 ZNF333Q96JL9 665 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 LRRC1Q9BTT6 524 aa24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 E5RJQ4 531 aa24.11■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 PIK3R2O00459 728 aa24.11■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 LONRF2Q1L5Z9 754 aa24.11■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.11■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 CD300LGQ6UXG3 332 aa24.11■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 ANKRD52Q8NB46 1076 aa24.11■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 JOSD2Q8TAC2 188 aa24.11■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 SLC2A14Q8TDB8 520 aa24.11■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 RAB21Q9UL25 225 aa24.11■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 KRIT1O00522 736 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 ENPP3O14638 875 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 LHX1P48742 406 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 TAS2R40P59535 323 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 NOMO2Q5JPE7 1267 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 SEL1L2Q5TEA6 688 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 SEPT8Q92599 483 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 SLC4A5Q9BY07 1137 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 MIS12Q9H081 205 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 TMEM161AQ9NX61 479 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 TSC2P49815 1807 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 I3L4J1 428 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 BCAT1P54687 386 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 BST2Q10589 180 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 KIAA0319Q5VV43 1072 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 KRT12Q99456 494 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 HIPK3Q9H422 1215 aa24.1■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
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PTX3-201ENST00000295927 F8VP50 259 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 PSTPIP1O43586 416 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 TKTP29401 623 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 BRCC3P46736 316 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 CLCN6P51797 869 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 FAAP100Q0VG06 881 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 CLUL1Q15846 466 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 CCDC142Q17RM4 750 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 OR6B2Q6IFH4 312 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 C8orf74Q6P047 294 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 RHOT1Q8IXI2 618 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 NIPA2Q8N8Q9 360 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 URGCPQ8TCY9 931 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 STK32AQ8WU08 396 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 SCLYQ96I15 445 aa24.09■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 B4GALT3O60512 393 aa24.08■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 DDHD2O94830 711 aa24.08■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 ODC1P11926 461 aa24.08■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 SSR1P43307 286 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
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PTX3-201ENST00000295927 TRIM60Q495X7 471 aa24.08■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa24.08■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 TMEM110Q86TL2 294 aa24.08■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 ZNF280BQ86YH2 543 aa24.08■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 EMC1Q8N766 993 aa24.08■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 HASPINQ8TF76 798 aa24.08■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.08■■□□□ 1.45
PTX3-201ENST00000295927 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
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