RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CAVIN3Q969G5 261 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF556Q9HAH1 456 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CAND2O75155 1236 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 RPS6KA5O75582 802 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 RSPH10BP0C881 870 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 SEC23AQ15436 765 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CBWD2Q8IUF1 395 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ATG4CQ96DT6 458 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ITGB3P05106 788 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 SNAPC2Q13487 334 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 VPS72Q15906 364 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 MEI1Q5TIA1 1274 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 SMIM5Q71RC9 77 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 TNIP2Q8NFZ5 429 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 DCDC2Q9UHG0 476 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CPS1P31327 1500 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ALDH1A1P00352 501 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 NQO1P15559 274 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 AKT1P31749 480 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 LAMC2Q13753 1193 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT18Q6ZVK8 323 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 RBBP8Q99708 897 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 PDP2Q9P2J9 529 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CPA2P48052 419 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2H3Q13889 308 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 PLD3Q8IV08 490 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CCT7Q99832 543 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 HEY2Q9UBP5 337 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 KDM1AO60341 852 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 EFCAB14O75071 495 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 NCAM1P13591 858 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A41Q8N5S1 370 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 PACSIN1Q9BY11 444 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ITPK1Q13572 414 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CD302Q8IX05 232 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 KAZALD1Q96I82 304 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 FAR2Q96K12 515 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 EPHB2P29323 1055 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 S100A5P33763 92 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 SPDYE7PQ495Y7 208 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL16Q8N461 479 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO25Q8TCJ0 367 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP99D6REC4 459 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 F8VZ95 297 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 FKBP9O95302 570 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 VDRP11473 427 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 NAMPTP43490 491 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CASP4P49662 377 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 FKBP9P1Q75LS8 142 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO36Q8NEA4 188 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 WNK4Q96J92 1243 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 HMBSP08397 361 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 TGM2P21980 687 aa21.95■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 NTRK3Q16288 839 aa21.95■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 STKLD1Q8NE28 680 aa21.95■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 EXD1Q8NHP7 514 aa21.95■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.11
CCSAP-201ENST00000284617 CTSHP09668 335 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 STYK1Q6J9G0 422 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 E2F8A0AVK6 867 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 TIMM44O43615 452 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 SKOR1P84550 965 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 PKN3Q6P5Z2 889 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 FAM162AQ96A26 154 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC126Q96EE4 140 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 SLC24A2Q9UI40 661 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 SOAT2O75908 522 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 PROSCO94903 275 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 RALBP11234 206 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-201ENST00000284617 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms