RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229384.5

GATC-201, Transcript of glutamyl-tRNA amidotransferase subunit C, humanhuman

TSL 2

Gene GATC, Length 372 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATC-201ENST00000229384 CHRDQ9H2X0 955 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 SEMA4AQ9H3S1 761 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 DMAC2Q9NW81 257 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 MYO16Q9Y6X6 1858 aa15.97■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 ATG2BQ96BY7 2078 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 NCAM2O15394 837 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CSH1P0DML2 217 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CSH2P0DML3 217 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 DLATP10515 647 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CCNE1P24864 410 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 PCSK1P29120 753 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 KMT5BQ4FZB7 885 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 TXNDC11Q6PKC3 985 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 MAB21L3Q8N8X9 362 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 BPIFB1Q8TDL5 484 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CCDC127Q96BQ5 260 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CHFRQ96EP1 664 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 XYLT2Q9H1B5 865 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 KCTD10Q9H3F6 313 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 LMAN1LQ9HAT1 526 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 GTSE1Q9NYZ3 720 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CDH9Q9ULB4 789 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 CCL26Q9Y258 94 aa15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
GATC-201ENST00000229384 SLC38A8A6NNN8 435 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 LAMTOR5O43504 91 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 LMNAP02545 664 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 TNNI1P19237 187 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 CTHP32929 405 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 MAGEA11P43364 429 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 CASP4P49662 377 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 CLDN10P78369 228 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 TNK2Q07912 1038 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 TXNDC8Q6A555 127 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 TSSK4Q6SA08 328 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 HS2ST1Q7LGA3 356 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 MON1AQ86VX9 555 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 YAF2Q8IY57 180 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 CEP57L1Q8IYX8 460 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 SUMF1Q8NBK3 374 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 ZBTB44Q8NCP5 570 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 SYT15Q9BQS2 421 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 ZMYM5Q9UJ78 669 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa15.95■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 SOBPA7XYQ1 873 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 LILRB5O75023 590 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 TACC1O75410 805 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 STAU1O95793 577 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 PDGFRBP09619 1106 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 FAM163BP0C2L3 166 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 PRR29P0C7W0 189 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 PSMD2Q13200 908 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 TAF12Q16514 161 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 MYLPFQ96A32 169 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 MSANTD3Q96H12 275 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 SPATA32Q96LK8 384 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 FNBP1Q96RU3 617 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 SLC22A12Q96S37 553 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 HPS4Q9NQG7 708 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 TMEM30AQ9NV96 361 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 USP25Q9UHP3 1055 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 MYH10P35580 1976 aa15.94■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 DPYSL4O14531 572 aa15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 BDNFP23560 247 aa15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 NDUFA8P51970 172 aa15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 MYL6P60660 151 aa15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 TTC8Q8TAM2 541 aa15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 PCED1BQ96HM7 432 aa15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 GCNAQ96QF7 691 aa15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 DPEP3Q9H4B8 488 aa15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 VRTNQ9H8Y1 702 aa15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 GKN1Q9NS71 199 aa15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 GCNT4Q9P109 453 aa15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
GATC-201ENST00000229384 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms