RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638708.1

STRADA-231, Transcript of STE20-related kinase adaptor alpha, human

TSL 2 BASIC

Gene STRADA, Length 2,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STRADA-231	ENST00000638708		A0A088AWK7	358 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	CCDC160	A6NGH7	325 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708		E9PBE3	544 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	TBX3	O15119	743 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	PSTPIP1	O43586	416 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	SNHG28	P0DPA3	235 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	FDX1	P10109	184 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	BGN	P21810	368 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	KLRK1	P26718	216 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ACADVL	P49748	655 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ERF	P50548	548 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	OXCT1	P55809	520 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	GSTM4	Q03013	218 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	FOLH1	Q04609	750 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	SNAPC2	Q13487	334 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	KLHL35	Q6PF15	583 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	TMC7	Q7Z402	723 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	AHI1	Q8N157	1196 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	BBS5	Q8N3I7	341 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	DDI1	Q8WTU0	396 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	UIMC1	Q96RL1	719 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	PAFAH2	Q99487	392 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	MAF1	Q9H063	256 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708		Q9H521	79 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ACP6	Q9NPH0	428 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	SOX13	Q9UN79	622 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	PPME1	Q9Y570	386 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	SBF2	Q86WG5	1849 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	CLUH	O75153	1309 aa		11.63	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	MAGEB3	O15480	346 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	LPXN	O60711	386 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	PDE5A	O76074	875 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ZNF24	P17028	368 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	FDFT1	P37268	417 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	GPX6	P59796	221 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	PPP4C	P60510	307 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	PDE1B	Q01064	536 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	PLCB3	Q01970	1234 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	KDSR	Q06136	332 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	NCOA4	Q13772	614 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	APOF	Q13790	326 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	CCNI	Q14094	377 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	SPIDR	Q14159	915 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	MYBPC2	Q14324	1141 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	KRT81	Q14533	505 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55	3e-7	■■■□□ 15.7
STRADA-231	ENST00000638708	MYLK3	Q32MK0	819 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	USP41	Q3LFD5	358 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708		Q6ZNX1	250 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	NLRX1	Q86UT6	975 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	TEKT1	Q969V4	418 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	C7orf26	Q96N11	449 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	INIP	Q9NRY2	104 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	CNTN3	Q9P232	1028 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ZNF536	O15090	1300 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55	8e-6	■■■■■ 107
STRADA-231	ENST00000638708	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708		E5RJQ4	531 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	CD48	P09326	243 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	CPOX	P36551	454 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	GJA8	P48165	433 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	TRIP10	Q15642	601 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	MYCT1	Q8N699	235 aa		11.62	□□□□□ -0.55
STRADA-231	ENST00000638708	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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