RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637015.1

ARID1B-223, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene ARID1B, Length 5,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-223	ENST00000637015	PLD3	Q8IV08	490 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	SPATA18	Q8TC71	538 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	HPS3	Q969F9	1004 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	RMND5A	Q9H871	391 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	TEX33	O43247	280 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	ICAM1	P05362	532 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	CSF1R	P07333	972 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	NCAM1	P13591	858 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	WLS	Q5T9L3	541 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	USP33	Q8TEY7	942 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	ARL8A	Q96BM9	186 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	FGFR4	P22455	802 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	RAD23B	P54727	409 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	ADCK1	Q86TW2	530 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	VPS50	Q96JG6	964 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	NAT9	Q9BTE0	207 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	CAMTA2	O94983	1202 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	WEE2	P0C1S8	567 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	CHRM3	P20309	590 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	TRPC1	P48995	793 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	DEFA1	P59665	94 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	DEFA3	P59666	94 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF544	Q6NX49	715 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	PSMD14	O00487	310 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	AKAP10	O43572	662 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	ITIH5	Q86UX2	942 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	IPMK	Q8NFU5	416 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	ADGRB3	O60242	1522 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	CYP11B2	P19099	503 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	GRK3	P35626	688 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	C3orf20	Q8ND61	904 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	DPP3	Q9NY33	737 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	WWOX	Q9NZC7	414 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	KDM6B	O15054	1643 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	TOMM70	O94826	608 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	PGK2	P07205	417 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	APBB2	Q92870	758 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015		A0A0G2JLW4	131 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	ESYT3	A0FGR9	886 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	VPS26A	O75436	327 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	IFNA14	P01570	189 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	UROD	P06132	367 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	VDR	P11473	427 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC9A1	P19634	815 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	STX5	Q13190	355 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	RASA1	P20936	1047 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	GUCY1A2	P33402	732 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	NAMPT	P43490	491 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	RAB27A	P51159	221 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	TERF2	Q15554	542 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF284	Q2VY69	593 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	WDCP	Q9H6R7	721 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ARID1B-223	ENST00000637015	OGT	O15294	1046 aa		12.85	□□□□□ -0.35

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