RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 TMTC4Q5T4D3 741 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 AGAP9Q5VTM2 703 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 CACHD1Q5VU97 1274 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 TAPT1Q6NXT6 567 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 TLDC1Q6P9B6 456 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM108Q6UXF1 575 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 LCNL1Q6ZST4 164 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 KIAA0408Q6ZU52 694 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 YAF2Q8IY57 180 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC150Q8NCX0 1101 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 PSD4Q8NDX1 1056 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 OR56A1Q8NGH5 318 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 POC1BQ8TC44 478 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 PPM1EQ8WY54 764 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 SNX27Q96L92 541 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 KCNC2Q96PR1 638 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 FMNL2Q96PY5 1086 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 PNKPQ96T60 521 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 MPHOSPH9Q99550 1183 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 MESP1Q9BRJ9 268 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 GPR87Q9BY21 358 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 STK33Q9BYT3 514 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 PCDHAC1Q9H158 963 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 MYLK2Q9H1R3 596 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 MAGEH1Q9H213 219 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 EPS8L2Q9H6S3 715 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 ZSCAN32Q9NX65 697 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 RGL1Q9NZL6 768 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 DKK4Q9UBT3 224 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 HESX1Q9UBX0 185 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 SORCS3Q9UPU3 1222 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 GPR52Q9Y2T5 361 aa2.66□□□□□ -1.98
SPTAN1-232ENST00000636483 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 DBX1A6NMT0 343 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 BTBD11A6QL63 1104 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 AHRRA9YTQ3 701 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 F5H697 171 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 TOR1BO14657 336 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 RGS10O43665 173 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 SH3BP5O60239 455 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 TLR5O60602 858 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM20BO75063 409 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF623O75123 536 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 ERN1O75460 977 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 RPS6KA4O75676 772 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 IPO13O94829 963 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 RASAL1O95294 804 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 GPANK1O95872 356 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 CHEK2O96017 543 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 PDHA1P08559 390 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 FGFR4P22455 802 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 KLRC1P26715 233 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 NTSR1P30989 418 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 SERPINF1P36955 418 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 MAPK9P45984 424 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 PXNP49023 591 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 CPT1AP50416 773 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 KRT17Q04695 432 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 FPGSQ05932 587 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF844Q08AG5 666 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 BIRC3Q13489 604 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 FHL3Q13643 280 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 BLMHQ13867 455 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 PTK2BQ14289 1009 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 ICAM4Q14773 271 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 LY6KQ17RY6 165 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF750Q32MQ0 723 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 VPS53Q5VIR6 699 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF585AQ6P3V2 769 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 GLB1LQ6UWU2 654 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 POLNQ7Z5Q5 900 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 RHOT2Q8IXI1 618 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 SPATA5Q8NB90 893 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 CPT1CQ8TCG5 803 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM171Q8WVE6 324 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 NACC2Q96BF6 587 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 TOX2Q96NM4 488 aa2.65□□□□□ -1.99
SPTAN1-232ENST00000636483 NELL2Q99435 816 aa2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms